当前解析结果
SmilChr06G000272| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000272 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000272 |
| 描述 | zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 1848748 - 1849647 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987828 |
|---|---|
| GeneID | 130987828 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987828 |
| 原始查询 | SmilChr06G000272 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5-like |
| 产物 | zinc finger protein SHOOT GRAVITROPISM 5-like |
| Arabidopsis | AT3G48550 (AT3G48550)SHOOT GRAVITROPISM-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824014] identity=67.4; qcov=0.667; evalue=2.14e-36; confidence=medium |
| Rice | Os04g0386300- identity=48; qcov=0.739; evalue=6.36e-22; confidence=medium |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0009630 (gravitropism) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987828 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767510.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767510.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767510.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057767510.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057767510.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:1848966 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,B100 |
Chr6:1849023 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B44,B95,C5,C79 |
Chr6:1849063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,B103,C49 |
Chr6:1849180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B133,C17,C77 |
Chr6:1849224 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B11,B134,B14,B4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。