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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000295`

染色体: Chr06 坐标: 2082229-2085173 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000295`
名称	SmilChr06G000295
描述	rhodanese-like domain-containing protein 6
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2082229 - 2085173 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990043`
GeneID	`130990043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990043`
原始查询	`SmilChr06G000295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 6
产物	rhodanese-like domain-containing protein 6
Arabidopsis	`AT1G09280` (AT1G09280) rhodanese-like domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837449] identity=69.1; qcov=0.819; evalue=3.98e-111; confidence=high
Rice	`Os12g0563400` (OsStr18) - identity=69.9; qcov=0.779; evalue=1.5e-109; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12368 (Rhodanese_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770227.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770227.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770227.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057770227.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2082324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:2082541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr6:2084573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:2084628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:2084629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr6:2084630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770227.1

281 aa

140

281

Rhodanese_C

PF12368 Rhodanese_C 166-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770227.1`	Pfam	`PF12368`	Rhodanese_C	Family	166	231	8.6e-15	55.5	Rhodanase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914244.1
ATGAGTCATGAGCATGTTGTTGCAGCAGGTCCCACTATAGGGACTTCAAAGGCAAAAGAACTGGTGACGTTAAGCTCTCATCCCTTGTTGAAGTCTCCGGAGATTTCAAATGCTGTGAGACATCTCTCGGCAGCTGAATTTCACTCTGTTCTTCAGAATGCTGGTGAATGTCAAGAGTTAAGTAGTGGCTCCAACAAGGAACTGATACTGTTAGATGCAAGAAACTTGTACGAGACGAGAATAGGCAAGTTTCATGCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990043
ATGAGTCATGAGCATGTTGTTGCAGCAGGTCCCACTATAGGGACTTCAAAGGCAAAAGAACTGGTGACGTTAAGCTCTCATCCCTTGTTGAAGTCTCCGGAGATTTCAAATGCTGTGAGACATCTCTCGGCAGCTGAATTTCACTCTGTTCTTCAGAATGCTGGTGAATGTCAAGAGTTAAGTAGTGGCTCCAACAAGGAACTGATACTGTTAGATGCAAGAAACTTGTACGAGACGAGAATAGGCAAGTTTCATGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770227.1
MSHEHVVAAGPTIGTSKAKELVTLSSHPLLKSPEISNAVRHLSAAEFHSVLQNAGECQELSSGSNKELILLDARNLYETRIGKFHALDIKTLDPAIRQYSDLPSWIDDNSEQLRGNNILMYCTGGIRCEMASAYIRSKGAGFENVFQLYGGIQRYMEQFPDGGFFKGKNFVFDHRVSVGSLDPIVLGTCLLCGVSFDNYTSRCRCTHCRMLVLVCDHCREINRSYVCELCQKDGKPVKSICSMSGEVPETAYDNQSLEID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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