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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000303`

染色体: Chr06 坐标: 2183427-2185901 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000303`
名称	SmilChr06G000303
描述	uncharacterized SmilChr06G000303
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2183427 - 2185901 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987861`
GeneID	`130987861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987861`
原始查询	`SmilChr06G000303`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821407]; symbol=AT3G18760; hit=AT3G18760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821407]; symbol=AT3G18760; hit=AT3G18760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G18760` (AT3G18760) Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821407] identity=60.9; qcov=0.945; evalue=1.03e-54; confidence=high
Rice	`Os01g0220300` (RPS6) - identity=60.1; qcov=0.945; evalue=7.43e-50; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01250 (Ribosomal_S6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767549.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057767549.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767549.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767549.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2184512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr6:2184541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr6:2185490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:2185539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C42,C85,D11
`Chr6:2185659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B7,B93,B97,B98,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767549.1

146 aa

146

Ribosomal_S6

PF01250 Ribosomal_S6 4-95 aa

XP_057767550.1

146 aa

146

Ribosomal_S6

PF01250 Ribosomal_S6 4-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767549.1`	Pfam	`PF01250`	Ribosomal_S6	Domain	4	95	4.9e-14	53.0	Ribosomal protein S6
`XP_057767550.1`	Pfam	`PF01250`	Ribosomal_S6	Domain	4	95	4.9e-14	53.0	Ribosomal protein S6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911566.1
ATTAATTAAGTCGAAAAAATAAAATAAAAATAAAATTATAACACTAGAAAAGAATCTCAAGATTTCGATCAGAGCCGCAGCGCCGCTCTTCTTTTTCTCCTCCAAGCTTCTTCTTCTGCATCATTACGGGTGCTGATATAGTTTGAAAGACAAGATGCCTCTTTATGACTGCATGCTTTTGGTGAAGCCCACTGTACCAAAGGAGGCCCTTCTTGATTTGCTTGCGCGGGTGGGAAAGCATGTTTACAGAAGAAATGGAG...

XM_057911567.1
GGAGGGTTATTCAGTAAAGATGACGCACCATGCAAGGTTAGCGGTGAAAAAAAATCGCCTAAGAAAGCTGCTGGTTAGCTTGAGTTGGACCCTGGCCAGCCAATTTTATCAATTTGTATGCGACTTTTGGATTTGAACGCGTTCTAAATTTAGAAGGGTGCTGATATAGTTTGAAAGACAAGATGCCTCTTTATGACTGCATGCTTTTGGTGAAGCCCACTGTACCAAAGGAGGCCCTTCTTGATTTGCTTGCGCGGGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987861
ATGCCTCTTTATGACTGCATGCTTTTGGTGAAGCCCACTGTACCAAAGGAGGCCCTTCTTGATTTGCTTGCGCGGGTGGGAAAGCATGTTTACAGAAGAAATGGAGTAGTGACTGATATGAAGTCCTTTGGAACTGTTCAATTGGGTTATGGAATTAGAAAACTCGATGGACGATATTATAAGGGCAATCTGCTACAGATGACTATGATGACACCGCCCAGCATAAACTCTGAGCTGTACTACCTGAACAAGGAAGACCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767549.1
MPLYDCMLLVKPTVPKEALLDLLARVGKHVYRRNGVVTDMKSFGTVQLGYGIRKLDGRYYKGNLLQMTMMTPPSINSELYYLNKEDRLLRWLLIKHRDFKFGGGSTGEVDIANELRDFSTIFKDGKIIEEEEDEDDDDDDDDEQSE

XP_057767550.1
MPLYDCMLLVKPTVPKEALLDLLARVGKHVYRRNGVVTDMKSFGTVQLGYGIRKLDGRYYKGNLLQMTMMTPPSINSELYYLNKEDRLLRWLLIKHRDFKFGGGSTGEVDIANELRDFSTIFKDGKIIEEEEDEDDDDDDDDEQSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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