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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000312`

染色体: Chr06 坐标: 2252940-2257472 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000312`
名称	SmilChr06G000312
描述	shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2252940 - 2257472 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987851`
GeneID	`130987851`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987851`
原始查询	`SmilChr06G000312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
产物	shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
Arabidopsis	`AT5G02890` (AT5G02890) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831751] identity=35; qcov=0.981; evalue=1.26e-51; confidence=medium
Rice	`Os04g0545700` (OSJNBa0079A21.8) - identity=30.2; qcov=1.04; evalue=1.2e-34; confidence=low
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767537.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057767537.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767537.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767537.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2253189`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A1
`Chr6:2253189`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A1
`Chr6:2253194`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C84
`Chr6:2253194`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C84
`Chr6:2253213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C78
`Chr6:2253244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C16
`Chr6:2253293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C1
`Chr6:2253342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:2253373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:2253374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C1
`Chr6:2253451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:2253472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B62,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767537.1

361 aa

180

361

Transferase

PF02458 Transferase 11-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767537.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	11	201	1.7e-23	83.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911554.1
TTTTCTTTTTTTCATCCCACATTTTAGTATCTGTTTCTATTTTTAATAAAAGTATGTGAGACCCTTACTCTACTTTAATTATTTTAACACTGCACATAAAAGGTGGGACCCTTATTCACTCACAACACACTCGACCATTTTATTAAAACTTGTGTGTCGCTCTCAAATTGATACTAAAAACCCGGAACGGAGGGAGTAATAATCTCGCTAGAGCATCGATTGTCTCAAAATCAATTCGACCTTATTTAAGAGGCTAGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987851
ATGGCAAATTCCGGCGTGAATGGCGGCAAAGTGCGCGTGGAAGGAATTCAAACGGTGGTTCCAACAAAGCCAACTGATCCGAGGCAACTATCAAGCAGAATCGCGGCGACTGTGATCAGCTCCACGGCGGCGCTGCAGCGGCGCTTCCACGTGGTCCTCTGCTACAACAAGGCCTCCTCCGACGACTCCGGATGGGTGGTGGCCGGGCGGATAAAGGAGTCGCTGGGAAGAGCCATGCAGGAGCAGCCCTTGCTCGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767537.1
MANSGVNGGKVRVEGIQTVVPTKPTDPRQLSSRIAATVISSTAALQRRFHVVLCYNKASSDDSGWVVAGRIKESLGRAMQEQPLLAGRLRWCQETDNFLQIVSNDSGARLVESKAEMELGAFVAMEEKREALAQLVFWEDLLHHTPHFSPLFYVQVTNFRCGGYSIGISCSLLLADPFALTAIIKKWANLHSKLVSTNEIPQIPTFYLPNHGTPPSSPSLLMGSNTAKDAAESVIFKIPAKVLDSDSKNLAALCVQEAER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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