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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000333`

染色体: Chr06 坐标: 2487023-2490987 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000333`
名称	SmilChr06G000333
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 27
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2487023 - 2490987 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987880`
GeneID	`130987880`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987880`
原始查询	`SmilChr06G000333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 27
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 27
Arabidopsis	`AT5G50870` (UBC27) ubiquitin-conjugating enzyme 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835159] identity=78.5; qcov=1; evalue=1.22e-114; confidence=high
Rice	`Os01g0925800` (OsUBC44) - identity=77.3; qcov=0.995; evalue=2.94e-103; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con); PF00627 (UBA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987880

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767564.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767564.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767564.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057767564.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767564.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2487863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr6:2489122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:2490728`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	C13,C74,C83,D6
`Chr6:2490728`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	C13,C74,C83,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767564.1

195 aa

195

UQ_con

UBA

PF00179 UQ_con 6-145 aa PF00627 UBA 158-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767564.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	6	145	1.1e-43	148.9	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057767564.1`	Pfam	`PF00627`	UBA	Domain	158	192	3.7e-08	33.8	UBA/TS-N domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911581.1
TTTATTTTTTTGACTATAATCCCTTCAAACAATGAGCAAATACGTCCAAAACTAGGGATATCATTTAACAGCATTTGGTATCTTTCGTCGACGCAGTGTTGCACGCTTCTTCTCTCTTATTGGGAAGAAGAGAGAGAAAGAAGCCGCGGAGGAGCATAAAACCTACACAAGCCCCACTACAAATCACTCTTCAACAGCCTCAATTCCACGTTTTTCATATCGAATTGGGGGAAGAGGTAGTCGGAGAAACATACGAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987880
ATGGTAGATTTTGCTAGGGTTCAGAAGGAATTGCAGGACTGCAATAAAGACTTCGAGGTTTCAGGGATAAAGGTCATACCTAAGGGTGAAACCAATCTCGCCTTCTTGCTTGGTACAATCCCTGGTCCTCTTGGTACACCTTATGAAGGTGGCACCTTCAAGATCGACATTACTCTGCCTGATGGTTACCCGTTTGAACCTCCCAAAATGCGGTTTGCCACTAAAGTATGGCACCCAAATATTAGCAGTCAAAGTGGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767564.1
MVDFARVQKELQDCNKDFEVSGIKVIPKGETNLAFLLGTIPGPLGTPYEGGTFKIDITLPDGYPFEPPKMRFATKVWHPNISSQSGAICLDILKDQWSPALTLKTALLSVQALLSAPEPDDPQDAVVAQQYLKDYQTFVGTARYWTEAFAKTSSLGVEEKVQKLVEMGFAEALVRSALESVGGDENLALEKLCSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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