当前解析结果
SmilChr06G000335| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000335 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000335 |
| 描述 | protein DEFECTIVE IN MERISTEM SILENCING 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 2513466 - 2521848 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987882 |
|---|---|
| GeneID | 130987882 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987882 |
| 原始查询 | SmilChr06G000335 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein DEFECTIVE IN MERISTEM SILENCING 3-like |
| 产物 | protein DEFECTIVE IN MERISTEM SILENCING 3-like |
| Arabidopsis | AT3G49250 (DMS3)defective in meristem silencing 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824086] identity=47.6; qcov=0.981; evalue=7.15e-117; confidence=high |
| Rice | Os01g0235200 (P0708G02.4-1)- identity=46.3; qcov=0.87; evalue=4.38e-117; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987882 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767567.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057767567.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.40000 | XP_057767567.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767567.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057767567.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:2513673 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,C13,C37,C83,D6 |
Chr6:2516308 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B118,B126,B19,B41,B44,C65,D3 |
Chr6:2516311 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B118,B126,B19,B41,B44,C65,D3 |
Chr6:2516401 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,C87 |
Chr6:2516526 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,B131 |
Chr6:2516899 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B46,C78 |
Chr6:2517208 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr6:2517259 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr6:2517283 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr6:2517436 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。