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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000336`

染色体: Chr06 坐标: 2525363-2527050 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000336`
名称	SmilChr06G000336
描述	rosmarinate synthase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2525363 - 2527050 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987883`
GeneID	`130987883`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987883`
原始查询	`SmilChr06G000336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rosmarinate synthase-like
产物	rosmarinate synthase-like
Arabidopsis	`AT5G48930` (HCT) hydroxycinnamoyl-CoA shikimate/quinate hydroxycinnamoyl transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834951] identity=50.2; qcov=1.03; evalue=2.01e-151; confidence=high
Rice	`Os04g0500700` (OsHCT1) hydroxycinnamoyltransferase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4336306] identity=46.6; qcov=1.05; evalue=1.81e-132; confidence=high
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00945 (Stilbenoid, diarylheptanoid and gingerol biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987883

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767568.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767568.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767568.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767568.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2525443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:2525549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B129,C64,C66,D3
`Chr6:2525553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:2525563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B33
`Chr6:2525620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B28,B47,C23
`Chr6:2525625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:2525627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C61
`Chr6:2525657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:2525660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:2525666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:2525702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:2525766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767568.1

425 aa

212

425

Transferase

PF02458 Transferase 3-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767568.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	3	423	1.3e-94	318.1	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911585.1
ATAAGGAGATCTCTTAGGTTGTGGGACGTAGGAAATTCCTCTCTTCCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCAACATGAGGATGAGTGTGAAAGAATCGACGATGGTGAGGCCGATGACAGAAACGCCGAGTGGGAGTCTATGGCTCTCGACTTTGGACTTACTAATGCCTGCTGCCTTCCACAGCCGCTCCGTACACTTGTACCGCTCCAATGGCGCTGCCAACTTCTTCGACGTTACCTTGCTCAAGGCGGCGCTTGGGCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987883
ATGAGGATGAGTGTGAAAGAATCGACGATGGTGAGGCCGATGACAGAAACGCCGAGTGGGAGTCTATGGCTCTCGACTTTGGACTTACTAATGCCTGCTGCCTTCCACAGCCGCTCCGTACACTTGTACCGCTCCAATGGCGCTGCCAACTTCTTCGACGTTACCTTGCTCAAGGCGGCGCTTGGGCGGGTCCTGGTTGACTTCTACCCCTATGCAGGGAGGCTGGAGAAGGCGGACAACGGCCGCATCCAGATCAACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767568.1
MRMSVKESTMVRPMTETPSGSLWLSTLDLLMPAAFHSRSVHLYRSNGAANFFDVTLLKAALGRVLVDFYPYAGRLEKADNGRIQINCNAEGVLFVEAECDDAVDDLGGFGRRALDLSLAPKVDYSLGISTFPLLLLQFTRFKCGSISLGVANEHHVSDGISALHFINTWSDAARGLTAAVVPPFLDRRLLSARSPPQPHFPHDEYQPPPRLTTPLPNTDTSHSTFKLTPGHLRALKQRCKSGYTTYEVVTGHVWRCVCAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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