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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000342`

染色体: Chr06 坐标: 2565349-2567265 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000342`
名称	SmilChr06G000342
描述	uncharacterized SmilChr06G000342
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2565349 - 2567265 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987889`
GeneID	`130987889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987889`
原始查询	`SmilChr06G000342`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication factor-A carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817356]; symbol=AT2G28105; hit=AT2G28105; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	replication factor-A carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817356]; symbol=AT2G28105; hit=AT2G28105; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G28105` (AT2G28105) replication factor-A carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817356] identity=49; qcov=0.887; evalue=4.3e-48; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767572.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057767572.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057767572.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767572.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2565821`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr6:2565821`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr6:2566556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:2566560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B6,C67
`Chr6:2566599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:2566659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr6:2566676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:2566688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B137,B86
`Chr6:2566755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B3,B35,B56,B96
`Chr6:2567115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:2567118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:2567215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767572.1

168 aa

168

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 21-121 aa

XP_057767574.1

168 aa

168

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 21-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767572.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	21	121	5.3e-08	33.5	Replication factor-A C terminal domain
`XP_057767574.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	21	121	5.3e-08	33.5	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911591.1
TAATAAAAATGAACAAACAAAGAGCCCGGCTAAAATTAAAAGACAATGATGAAAAACAACATAAAATCCAAACAAATAAAAACTTAAATCTTGCGCCGCTTCTTTCTTCTCTCTTCTCACTCTCGTCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTCGTCTCCGGCCTCCGTGCCGCCGCCCTCGCCGGCTTGCTCAACCTCTCGGTTTCTTTCATCTCCTCTTTCGGTGCGCCGCCGCCCTCCCAAACTCGCCCAGTCTTCCCCGTCGC...

XM_057911589.1
TAAAAGACAATGATGAAAAACAACATAAAATCCAAACAAATAAAAACTTAAATCTTGCGCCGCTTCTTTCTTCTCTCTTCTCACTCTCGTCTCCTTCTGTCTCTCTCTCTCGTCTCCGGCCTCCGTGCCGCCGCCCTCGCCGGCTTGCTCAACCTCTCGGTTTCTTTCATCTCCTCTTTCGGTGCGCCGCCGCCCTCCCAAACTCGCCCAGTCTTCCCCGTCGCCCCGCCTCCTCCGTTCGCAGCAGCAGCAGTGGCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987889
ATGTCGATTTCCGGCGAGCATAGCAGAAAACGGCCGTTTACAGAAACAGATCAGCCGGCGACAATCCTGTGCACAGTGGTAGCAATCGATTACAGCAATCTCTTCTACAGAGTGTGTAGTGCGTGCGAAAGGACTCTGCCGGAGAATCCCGACGGTTGTTGCCGTCACTGCAACATCACCAACGGCTTCAATCCTGCTTCCAAACGCCTCTTTCGTGTTCTCATGTCAATCGGTACAGATACGAAGATCATGGTGGTGAT...

LOC130987889
ATGTCGATTTCCGGCGAGCGTAGCAGAAAACGGCCGTTTACAGAAACAGATCAGCCGGCGACAATCCTGTGCACAGTGGTAGCAATCGATTACAGCAATCTCTTCTACAGAGTGTGTAGTGCGTGCGAAAGGACTCTGCCGGAGAATCCCGACGGTTGTTGCCGTCACTGCAACATCACCAACGGCTTCAATCCTGCTTCCAAACGCCTCTTTCGTGTTCTCATGTCAATCGGTACAGATACGAAGATCATGGTGGTGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767572.1
MSISGERSRKRPFTETDQPATILCTVVAIDYSNLFYRVCSACERTLPENPDGCCRHCNITNGFNPASKRLFRVLMSIGTDTKIMVVIMFDRAARVLFGCSADDFFNFAKTHPYASATASKALEGEMLTVTLSKPKNGNAQHLRVVSVVPMGTGFQPAIHTLKELYPHY

XP_057767574.1
MSISGEHSRKRPFTETDQPATILCTVVAIDYSNLFYRVCSACERTLPENPDGCCRHCNITNGFNPASKRLFRVLMSIGTDTKIMVVIMFDRAARVLFGCSADDFFNFAKTHPYASATASKALEGEMLTVTLSKPKNGNAQHLRVVSVVPMGTGFQPAIHTLKELYPHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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