当前解析结果
SmilChr06G000345| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000345 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000345 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000345 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 2617274 - 2619777 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987892 |
|---|---|
| GeneID | 130987892 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987892 |
| 原始查询 | SmilChr06G000345 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | DNA-directed RNA polymerase III subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828101]; symbol=AT4G01590; hit=AT4G01590; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | DNA-directed RNA polymerase III subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828101]; symbol=AT4G01590; hit=AT4G01590; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G01590 (AT4G01590)DNA-directed RNA polymerase III subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828101] identity=30.6; qcov=0.716; evalue=1.22e-13; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0006383 (transcription by RNA polymerase III) |
| KEGG | smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987892 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057767578.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057767578.1 |
| 3 | Nucleolar fibrillar center | Nucleolar fibrillar center | 0.40000 | XP_057767578.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057767579.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057767578.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:2619533 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。