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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000348`

染色体: Chr06 坐标: 2635698-2637976 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000348`
名称	SmilChr06G000348
描述	uncharacterized SmilChr06G000348
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2635698 - 2637976 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987895`
GeneID	`130987895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987895`
原始查询	`SmilChr06G000348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	translocon-associated protein beta (TRAPB) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831251]; symbol=AT5G14030; hit=AT5G14030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	translocon-associated protein beta (TRAPB) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831251]; symbol=AT5G14030; hit=AT5G14030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G14030` (AT5G14030) translocon-associated protein beta (TRAPB) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831251] identity=51.4; qcov=0.762; evalue=1.46e-51; confidence=high
Rice	`Os01g0102700` - identity=51.2; qcov=0.683; evalue=2.19e-43; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05753 (TRAP_beta)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767580.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057767580.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057767580.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767580.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2635875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D7
`Chr6:2635880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:2635977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A8,B103,C1
`Chr6:2637191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C78
`Chr6:2637389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767580.1

189 aa

189

TRAP_beta

PF05753 TRAP_beta 41-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767580.1`	Pfam	`PF05753`	TRAP_beta	Family	41	184	6.3e-37	127.4	Translocon-associated protein beta (TRAPB)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089873.1
GCCATCAAGCCCATATCCTAGAGTGGGCTTGGCCCATTTCGGACGATATAAAGGAAGACTTCGTACCAATGTCCGTACGAGTCGAGGCGACTGACAGTGAAATCTTCCTAGAAAACGAAGGAATACAGTTTGAAATTGAAGAATCAATGGCGAACTACTTGCCATCGCCGATCGTCGCCGTCGCATGCGCGATCTCAATTCTTTGTTTGTCTTTTGTGGAATCCGCAAATTCACCGTTTCTCGTGGCTCATAAAAGAGTT...

XM_057911597.1
GCCATCAAGCCCATATCCTAGAGTGGGCTTGGCCCATTTCGGACGATATAAAGGAAGACTTCGTACCAATGTCCGTACGAGTCGAGGCGACTGACAGTGAAATCTTCCTAGAAAACGAAGGAATACAGTTTGAAATTGAAGAATCAATGGCGAACTACTTGCCATCGCCGATCGTCGCCGTCGCATGCGCGATCTCAATTCTTTGTTTGTCTTTTGTGGAATCCGCAAATTCACCGTTTCTCGTGGCTCATAAAAGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987895
ATGTCCGTACGAGTCGAGGCGACTGACAGTGAAATCTTCCTAGAAAACGAAGGAATACAGTTTGAAATTGAAGAATCAATGGCGAACTACTTGCCATCGCCGATCGTCGCCGTCGCATGCGCGATCTCAATTCTTTGTTTGTCTTTTGTGGAATCCGCAAATTCACCGTTTCTCGTGGCTCATAAAAGAGTTTCTCACACGAAGATGAATTCGGATTTGGAGCGGGTGTCCGTCTCCATCGACATTTATAACACTGGATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767580.1
MSVRVEATDSEIFLENEGIQFEIEESMANYLPSPIVAVACAISILCLSFVESANSPFLVAHKRVSHTKMNSDLERVSVSIDIYNTGSEPAYDVTLYDDNWAEEVFNTVIGNTSKTWEKLDSGSLVSHSFELESKVKTVYYGTPALITFRIPTNSKLQEAYSTPILPVRILSESTAENTIEIVIFFYLLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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