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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000359`

染色体: Chr06 坐标: 2742113-2743932 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000359`
名称	SmilChr06G000359
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2742113 - 2743932 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987907`
GeneID	`130987907`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987907`
原始查询	`SmilChr06G000359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES-like
Arabidopsis	`AT2G02640` (AT2G02640) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814793] identity=27.5; qcov=0.944; evalue=3.21e-18; confidence=low
Rice	`Os07g0610200` - identity=28.8; qcov=0.704; evalue=1.71e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987907

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767595.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767595.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767595.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767595.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2742245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B35,B94,C22
`Chr6:2742261`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B124,B35,B94,C57,D6
`Chr6:2742261`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B124,B35,B94,C57,D6
`Chr6:2742269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B45,C50,C69,C80
`Chr6:2742272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr6:2742278`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A20,B104,B136,B45,C27,C43,C50,C68,C70
`Chr6:2742289`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B124,C57
`Chr6:2742289`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B124,C57
`Chr6:2742290`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B124,C57
`Chr6:2742290`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B124,C57
`Chr6:2742297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A20,B104,B136,B35,B45,B94,C27,C43,C50,C68,C70,C80
`Chr6:2742312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A11,A2,B20,B27,B60,C1,C26,C33,C43,C45,C48,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767595.1

301 aa

150

301

C1_2

PF03107 C1_2 18-72 aa PF03107 C1_2 81-127 aa PF03107 C1_2 144-188 aa PF03107 C1_2 201-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767595.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	18	72	2.7e-31	108.3	C1 domain
`XP_057767595.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	81	127	2.7e-31	108.3	C1 domain
`XP_057767595.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	144	188	2.7e-31	108.3	C1 domain
`XP_057767595.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	201	250	2.7e-31	108.3	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911612.1
TATATATAATATAGTATTGTCTTTTCGAGAGTGCAGTTAGTGATAATTAAGAAGAGAAGAAAAAGAATGTCGAGAGAGAAAGAAGGAGAAATGGAGAAGGAGAGTATTCCTCATATATTTCATCAACACCCGCTGAGTTTGATCCCCAACCGGGCCGCGGAAACTGATAATTCTTGGAGCACTTGGTGTTATGGTTGTTGGAGATACTTTTTACCAGGAGAGGCAGCCTATGGATGCAGCCAAAAATGTGGAATGAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987907
ATGTCGAGAGAGAAAGAAGGAGAAATGGAGAAGGAGAGTATTCCTCATATATTTCATCAACACCCGCTGAGTTTGATCCCCAACCGGGCCGCGGAAACTGATAATTCTTGGAGCACTTGGTGTTATGGTTGTTGGAGATACTTTTTACCAGGAGAGGCAGCCTATGGATGCAGCCAAAAATGTGGAATGAATTGGCTATTACACAAAGAATGCATGGAGATGCCGAGAGAGATCCGCCATCCTCTCCACCCTTCACACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767595.1
MSREKEGEMEKESIPHIFHQHPLSLIPNRAAETDNSWSTWCYGCWRYFLPGEAAYGCSQKCGMNWLLHKECMEMPREIRHPLHPSHSLTLQDSSYAATRSCAVCEFVAYGLLYKCSGGCEWWIHFGCTGDFEAAVVDDSTMKHPSHPQHQLIKKTRWCSFPCDACGATHKGKSYICTLCDYWLHETCALLPVSAPFPHHRPDHYLSLAFNLPYEYIKYEFVCAICSETLPMRRWVYHCQLCRYVVHINCATNTSSLSLSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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