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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000374`

染色体: Chr06 坐标: 2882841-2886229 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000374`
名称	SmilChr06G000374
描述	purple acid phosphatase 17-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	2882841 - 2886229 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987922`
GeneID	`130987922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987922`
原始查询	`SmilChr06G000374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purple acid phosphatase 17-like
产物	purple acid phosphatase 17-like
Arabidopsis	`AT3G17790` (PAP17) purple acid phosphatase 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821047] identity=62.4; qcov=0.967; evalue=4.77e-155; confidence=high
Rice	`Os03g0238600` (OsPAP3c) - identity=62.9; qcov=0.898; evalue=4.71e-138; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0008199 (ferric iron binding)
KEGG	smil00740 (Riboflavin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057767612.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767612.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767612.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767612.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:2883243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C73
`Chr6:2883380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C2,C78
`Chr6:2883419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C26
`Chr6:2883428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:2883430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B8,C3
`Chr6:2883431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr6:2884133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,C26,C36,C53,C55
`Chr6:2884622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B45,C14,C55,C73
`Chr6:2886005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767612.1

333 aa

166

333

Metallophos

PF00149 Metallophos 45-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767612.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	45	254	3.5e-21	77.3	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911629.1
CTCTTCTCCAAAAAAAATTAAAAAAAATAAATAAAAACTTCTCTTTATCGTTCTTCCTTGTAAATTTCTTTTTTCAAAGAAAAAAAAAATAAACATCTCTTTTTCTTGTCAGTCAGAGAAATTATTGAAATGGGTATTTCTGAGAAGAAAACCATGAAAATTATTATGTTGTGCCTCTGGCTGGCGACGATCTCCTTAATTTGTGGCCAAATTTCTGCTAACTTGCCAAAATTTGAGCATCCCACAAAAGGTGATGGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987922
ATGGGTATTTCTGAGAAGAAAACCATGAAAATTATTATGTTGTGCCTCTGGCTGGCGACGATCTCCTTAATTTGTGGCCAAATTTCTGCTAACTTGCCAAAATTTGAGCATCCCACAAAAGGTGATGGAACTCTCAGATTTTTGGTTATTGGAGATTGGGGAAGAAAAGGAGAGTATAACCAATCTCATGTTGCAGCTCAGATGGGAAGAATTGGAGAAGAATTAGATATAGATTTTGTAATTTCAACAGGTGATAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767612.1
MGISEKKTMKIIMLCLWLATISLICGQISANLPKFEHPTKGDGTLRFLVIGDWGRKGEYNQSHVAAQMGRIGEELDIDFVISTGDNFYDNGLQGETDPNFVESFTNIYTAKSLQKPWYTVLGNHDYRGDAVAQMSPILQKIDSRWLCLRSFVVNAEVAEIFLVDTTPFVTDYFINPEHVYDWRGVVPSKSYTSYALKDLEIALKESRAKWKIVVGHHAIRSVGHHGDTTELVNLLLPVLQANGVDFYMNGHDHCLEQISD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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