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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000382`

染色体: Chr06 坐标: 3020584-3022799 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000382`
名称	SmilChr06G000382
描述	uncharacterized SmilChr06G000382
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3020584 - 3022799 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990053`
GeneID	`130990053`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990053`
原始查询	`SmilChr06G000382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745710]; symbol=AT4G16015; hit=AT4G16015; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745710]; symbol=AT4G16015; hit=AT4G16015; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G16015` (AT4G16015) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745710] identity=24.6; qcov=0.951; evalue=1.94e-22; confidence=weak
Rice	`Os07g0611200` - identity=27.7; qcov=0.337; evalue=4.3e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990053

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770234.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770234.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770234.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770234.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3020585`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B118,B50,B55,B60,B65,B66,B75,B83,B90,C3,C32,C38,C63,D8
`Chr6:3020613`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B90
`Chr6:3020613`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B90
`Chr6:3020619`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B109,B90
`Chr6:3020619`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B109,B90
`Chr6:3020653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A21,B139,B26,B98
`Chr6:3020664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:3020695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C75
`Chr6:3020709`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,D3
`Chr6:3020709`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,D3
`Chr6:3020711`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,D3
`Chr6:3020711`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B41,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770234.1

492 aa

246

492

C1_2

PF03107 C1_2 49-95 aa PF03107 C1_2 257-298 aa PF03107 C1_2 367-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770234.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	49	95	7.4e-33	113.4	C1 domain
`XP_057770234.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	257	298	7.4e-33	113.4	C1 domain
`XP_057770234.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	367	415	7.4e-33	113.4	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914251.1
ATGACCATTGGATGTGCAGTTTGTGAATTGTATGGGCATGGGCTATTCTACAAATGTAGTGGGGGATGTGAGTGGTGGATCCACTTGGGATGCACAGGGGATTTTGATGCAGCAGTAGTTGATGATGTTCCAACAATGAAGCACCCAAGCCACCCCAAACACTACCTCATATTTTCCAAGAAAACAAGGTGGTGCTCCTTCCCCTGTGATGCATGTGGCGCCTCTCACAAAGGGAACTCCTACATCTGCACCCTTTGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990053
ATGACCATTGGATGTGCAGTTTGTGAATTGTATGGGCATGGGCTATTCTACAAATGTAGTGGGGGATGTGAGTGGTGGATCCACTTGGGATGCACAGGGGATTTTGATGCAGCAGTAGTTGATGATGTTCCAACAATGAAGCACCCAAGCCACCCCAAACACTACCTCATATTTTCCAAGAAAACAAGGTGGTGCTCCTTCCCCTGTGATGCATGTGGCGCCTCTCACAAAGGGAACTCCTACATCTGCACCCTTTGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770234.1
MTIGCAVCELYGHGLFYKCSGGCEWWIHLGCTGDFDAAVVDDVPTMKHPSHPKHYLIFSKKTRWCSFPCDACGASHKGNSYICTLCDYWIHETCALLPISNNENAVADVKDIIKGPIDDIYEEIIRPFVKRVRELVSIPQKTCHKHHLLSFTTFPSSSPPSSTHHHNHEEEEEEEEDYKEDSNIPGLELTCDGCTLPIHEKTQRDEYENGYMSCDECKYFLHLSCFNLPPHLPSHPLHLSCFNLQPYNPFFSPYPFNLTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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