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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000390`

染色体: Chr06 坐标: 3092819-3095256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000390`
名称	SmilChr06G000390
描述	uncharacterized SmilChr06G000390
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3092819 - 3095256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987937`
GeneID	`130987937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987937`
原始查询	`SmilChr06G000390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pi9(t); symbol=Pi9(t); hit=Os06g0146100; species=rice; confidence=weak
产物	Pi9(t); symbol=Pi9(t); hit=Os06g0146100; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G50950` (ZAR1) HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824259] identity=31.6; qcov=0.545; evalue=4.79e-06; confidence=low
Rice	`Os06g0146100` (Pi9(t)) - identity=23.1; qcov=0.807; evalue=1.29e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767630.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767630.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767630.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767630.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767630.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3093023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr6:3093023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:3093208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B23,B53,C58
`Chr6:3093376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr6:3094910`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A7,B1,B114,B137,B22,B41,B44,B59,B69,B82,B86,B93,B95,C5,C74,C79,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767630.1

169 aa

169

Rx_N

PF18052 Rx_N 7-87 aa

XP_057767632.1

169 aa

169

Rx_N

PF18052 Rx_N 7-87 aa

XP_057767633.1

145 aa

145

Rx_N

PF18052 Rx_N 7-87 aa

XP_057767634.1

145 aa

145

Rx_N

PF18052 Rx_N 7-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767630.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	7	87	2.8e-15	56.9	Rx N-terminal domain
`XP_057767632.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	7	87	2.8e-15	56.9	Rx N-terminal domain
`XP_057767633.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	7	87	2.1e-15	57.3	Rx N-terminal domain
`XP_057767634.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	7	87	2.1e-15	57.3	Rx N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911650.1
CTGAAAAAATATTAAACAATTTCTTGTTTTTTCTCGGTGACCAAGAAATTTCGTGGGTATTTCTTGTTTGTTTAATTTGAGCTATAAAGACGCAGCTAGGAGAGTAAATTCATCTGCAGTTGTAGAGCTAAAGAAGCATAGTGGAGAATGGTGGATGCTGCGACGACATTCATACTGGATATGGTGAAGGAACTGGTGGTGGAGCAGATAGATCTGATATCGGGGGCGGAGAAGGAGCTGAAGCAGGTGCAGAGCGAGCT...

XM_057911651.1
CTGAAAAAATATTAAACAATTTCTTGTTTTTTCTCGGTGACCAAGAAATTTCGTGGGTATTTCTTGTTTGTTTAATTTGAGCTATAAAGACGCAGCTAGGAGAGTAAATTCATCTGCAGTTGTAGAGCTAAAGAAGCATAGTGGAGAATGGTGGATGCTGCGACGACATTCATACTGGATATGGTGAAGGAACTGGTGGTGGAGCAGATAGATCTGATATCGGGGGCGGAGAAGGAGCTGAAGCAGGTGCAGAGCGAGCT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130987937
ATGGTGGATGCTGCGACGACATTCATACTGGATATGGTGAAGGAACTGGTGGTGGAGCAGATAGATCTGATATCGGGGGCGGAGAAGGAGCTGAAGCAGGTGCAGAGCGAGCTGGAGCTGATGAATGCGTTCTTGATGGAGTACGCGGCGAAGCAGGAGAAGGGTGAGGTGTTCATACATTTTGAGAGGCAGATCATGGAGGCTGTCTACAAGGCCGAGGACACCATCGACGCCTGCCTCACCCACAAGGCCAAATCCGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057767630.1
MVDAATTFILDMVKELVVEQIDLISGAEKELKQVQSELELMNAFLMEYAAKQEKGEVFIHFERQIMEAVYKAEDTIDACLTHKAKSGGGGVLNLKHHLDLAKKVKELRLQLQPIFDRTIQAFNASAEPQGTSDDNKFKKFEKLTFSVIGVLLLGSVRFIYLHSRKNVKD

XP_057767632.1
MVDAATTFILDMVKELVVEQIDLISGAEKELKQVQSELELMNAFLMEYAAKQEKGEVFIHFERQIMEAVYKAEDTIDACLTHKAKSGGGGVLNLKHHLDLAKKVKELRLQLQPIFDRTIQAFNASAEPQGTSDDNKFKKFEKLTFSVIGVLLLGSVRFIYLHSRKNVKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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