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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000394`

染色体: Chr06 坐标: 3150565-3152298 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000394`
名称	SmilChr06G000394
描述	protein BASIC PENTACYSTEINE2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3150565 - 3152298 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987941`
GeneID	`130987941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987941`
原始查询	`SmilChr06G000394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BASIC PENTACYSTEINE2-like
产物	protein BASIC PENTACYSTEINE2-like
Arabidopsis	`AT1G14685` (BPC2) basic pentacysteine 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838031] identity=48.4; qcov=1.02; evalue=1.07e-81; confidence=high
Rice	`Os10g0114500` - identity=68.8; qcov=0.453; evalue=2.59e-63; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0009723 (response to ethylene); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF06217 (GAGA_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767639.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767639.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767639.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767639.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3151037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr6:3151205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C39,C48,C83
`Chr6:3151292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D8
`Chr6:3151454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr6:3151458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C63
`Chr6:3151472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C20,C36,C50
`Chr6:3151486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B46,C29,C45,D2
`Chr6:3151653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr6:3151673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B109,B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767639.1

311 aa

156

311

GAGA_bind

PF06217 GAGA_bind 1-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767639.1`	Pfam	`PF06217`	GAGA_bind	Domain	1	311	1.3e-85	288.8	GAGA binding protein-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911656.1
GGAGATTTCTCTATTTTTGTGCCATTTTTCCCAACCCTTCTCCCCTTCCCAAGGAGGGCTTAAAATCTGAAGGAAACAATTAAAAAACCCTAAATCGGCCGACTCTCATTCTCTCAGGTTTGCGATCATTATCTCGAGAGCGACTTTACGTCATTTTGATTATTTTGGTGAAATCTCATTTCGGATTATTGCTGAGTTATTGTACGGTCGAATTCATATTTTTCGCGGGTTTGTTGAGTTTGATATTTGGAAATAACATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987941
ATGGATGGAAATGGGAATATGAATTTTAGGAATTGGGGGTTTCTTGAACCCCCAGCAAGTAGTATGAAGAACCAGCTTGGCCTTCAGTTAATAACTTCCATGGCTGAGAAGCCCCTCTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGATTTCGTGACCACCAGAACTTGCACCCGTCGCCGGTCATGTCATCTATCAATGGTGGGCCGTTTCATCACCATCGTGTTGGTGGTATTTCAGAATCCCACATTCCCGTCGACTATTGGATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767639.1
MDGNGNMNFRNWGFLEPPASSMKNQLGLQLITSMAEKPLFGGGGGGFRDHQNLHPSPVMSSINGGPFHHHRVGGISESHIPVDYWMNQSREKYLNVLPVNHQPAYYQSSYGVSPESSSAHSVQMPQQFNLQKAENVMSEMEEMCEEKDDGGCSSGGAVVVKKRGGSKVTNSTPKEKKPRTRTPRPPRDEPTPPSSRARIPKKRAEIVINGINMDISEIPIPVCSCTGAPQQCYRWGSGGWQSACCTTHMSEYPLPPSDKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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