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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000395`

染色体: Chr06 坐标: 3154344-3160508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000395`
名称	SmilChr06G000395
描述	protein PAM71-homolog, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3154344 - 3160508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987943`
GeneID	`130987943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987943`
原始查询	`SmilChr06G000395`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PAM71-homolog, chloroplastic-like
产物	protein PAM71-homolog%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G13590` (AT4G13590) Uncharacterized protein family (UPF0016) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826992] identity=71.2; qcov=0.874; evalue=1.03e-142; confidence=high
Rice	`Os11g0544500` - identity=65; qcov=0.84; evalue=6.1e-125; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0009507 (chloroplast); GO:0015085 (calcium ion transmembrane transporter activity); GO:0032468 (Golgi calcium ion homeostasis); GO:0032472 (Golgi calcium ion transport); GO:0070588 (calcium ion transmembrane transport); GO:0071421 (manganese ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01169 (GDT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767640.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057767640.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057767640.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057767640.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3154650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B67,D2,D4
`Chr6:3154675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr6:3156389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B33,B8,C3
`Chr6:3157469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:3158369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:3158390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B12,B55,C78
`Chr6:3158408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:3158805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:3158866`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B115
`Chr6:3158866`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B115
`Chr6:3158898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B84,C16,C26,C47
`Chr6:3160036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C16,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767640.1

357 aa

178

357

GDT1

PF01169 GDT1 144-232 aa PF01169 GDT1 274-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767640.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	144	232	3.7e-43	146.4	Divalent cation/proton antiporter GDT1
`XP_057767640.1`	Pfam	`PF01169`	GDT1	Domain	274	355	3.7e-43	146.4	Divalent cation/proton antiporter GDT1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911657.1
TCAAAATTCTAGAAAAATATAGAATTCCCAAATACTTCCAAAATTCCTTCCCAAACACACCACACGCCCAGTAGGAAGCAGCCACACAACACAATCTTCTTCTCTCGCGTCTCCTCCTCTCTGCACCCAAAGATTTTCACTGAAATGGGACACAAAATCTCCTAACTGAAACCAGATTATCTGCCAGTTGAAAAGAGCAACAAAATGCAAGTTTTGGCTTCTCAGACTCCCCAAATTTTATCATCAACCACCGACAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987943
ATGCAAGTTTTGGCTTCTCAGACTCCCCAAATTTTATCATCAACCACCGACAAAATTGCTCGCCCGCTTTCTGGGTTGATTACCACACTGCCGTTTTCTCCTCTGGTGCCCGGGAAAATCACCAGATCATCTTCTTCGTTGCAATACAGAGAGGCACCAAGATATGCTGCGGGGAGCAGATCAATTAGATCACATGCTTTGAATGTGGGAGCTGGATCTGGTAGCTATGACGAGAGGCAGGGAAACGACAGCCAGAGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767640.1
MQVLASQTPQILSSTTDKIARPLSGLITTLPFSPLVPGKITRSSSSLQYREAPRYAAGSRSIRSHALNVGAGSGSYDERQGNDSQSSSAEQHTETSSKIEKSPDRIPYLFPIAVVLCSCTLAFLLILLKNGPASVLPALAKSGFTAAFSLIFVSEIGDKTFFIAALLAMQYEKVLVLLGSVGALSLMTVLSVIIGRIFHSVPAQFQTTLPIGEYAAVTLLVFFGLKSIKDAWDLPSAAAKTGEPSNQESDEFAEAEELVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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