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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000399`

染色体: Chr06 坐标: 3204180-3207020 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000399`
名称	SmilChr06G000399
描述	probable inactive receptor kinase At1g48480
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3204180 - 3207020 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987948`
GeneID	`130987948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987948`
原始查询	`SmilChr06G000399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive receptor kinase At1g48480
产物	probable inactive receptor kinase At1g48480
Arabidopsis	`AT1G48480` (RKL1) receptor-like kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841269] identity=62.5; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0223000` (OsRLCK377) - identity=60.4; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767646.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767646.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767646.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767646.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767646.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3205630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B55,B6,C67
`Chr6:3205675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C46,C83,D3
`Chr6:3205725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr6:3205757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3205769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B50,B72,C54
`Chr6:3205771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:3205825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3205840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:3205915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr6:3205944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B36,B93,D10
`Chr6:3205945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3205987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767646.1

642 aa

321

642

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 26-61 aa PF13855 LRR_8 66-125 aa PF00560 LRR_1 91-112 aa PF00560 LRR_1 114-136 aa PF00560 LRR_1 139-160 aa PF00069 Pkinase 358-617 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 358-619 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	26	61	2e-08	35.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	66	125	1.7e-12	47.6	Leucine rich repeat
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	91	112	3.2e-12	44.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	114	136	3.2e-12	44.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	139	160	3.2e-12	44.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	358	617	1.4e-35	123.7	Protein kinase domain
`XP_057767646.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	358	619	7.2e-35	121.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911663.1
CTAACCAATGAATCTATTATATAAATAAATTGTTTTTTTCTCTCTCCCTCTCTATAGAGTACCCTCATTCCCAGCCTGGATCCCTCTCTCTCTATCTCTACCTGTGCCACTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACAAATATACCAGAGCAGAGAACACGCAGATATACATACACACACACACACATTCATAGTGTCAGTCACACCTCGAGTGATTCCTCCACCCCATAAGTCGCCCCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987948
ATGGCGACTGCACAGCTCCCAGCAATGGTGCTGCTCCTCGTCGTCCTCGTCTCCGCCGCCAGCGGCGCAGATCTCTCCAGCGACCGCGCCGCCCTCTTAGCCCTCCGGTCGGCGGTGGGGGGGCGCACCCTCTTCTGGAACACCACCGCCAGCAGCCCATGCAACTGGGCCGGCGTCCTCTGCGAAGACAACCGCGTCACCGTCCTTCGCCTCCCCGCCGCCTCCCTCTTCGGCGCCCTCCCCGCCTCCGCCCTCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767646.1
MATAQLPAMVLLLVVLVSAASGADLSSDRAALLALRSAVGGRTLFWNTTASSPCNWAGVLCEDNRVTVLRLPAASLFGALPASALSNLTALRTLSLRLNHLSGPLPPDLSSLSQLRNLYLQGNHFSGPTPPSLFSLHALVRLNLADNNFSGTIPSAFNNLTRLRTLFLENNRFAGNLPDIDLPNLDQFNVSFNNLNGSVPKGLVRKSKDSFLGTSLCGKPLDTVCADNAGQTPSIAAEPTTGGKKKKKLSGGAIAGIAIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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