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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000427`

染色体: Chr06 坐标: 3505363-3508551 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000427`
名称	SmilChr06G000427
描述	protein MHF1 homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3505363 - 3508551 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987978`
GeneID	`130987978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987978`
原始查询	`SmilChr06G000427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MHF1 homolog
产物	protein MHF1 homolog
Arabidopsis	`AT5G50930` (AT5G50930) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835166] identity=68.8; qcov=0.926; evalue=4.08e-55; confidence=high
Rice	`Os04g0397700` - identity=66.7; qcov=0.667; evalue=2.34e-42; confidence=medium
GO	GO:0000712 (resolution of meiotic recombination intermediates); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0031297 (replication fork processing); GO:0043240 (Fanconi anaemia nuclear complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity); GO:0071821 (FANCM-MHF complex)
KEGG	smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF15511 (CENP-T_C); PF15630 (CENP-S)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767694.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057767694.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057767694.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767694.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3505650`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A22,A9,B101,B104,B105,B107,B108,B111,B117,B123,B126,B130,B132,B135,B139,B2,B26,B27,B3,B32,B36,B42,B43,B50,B57,B58,B61,B64,B74,B80,B84,B98,C10,C18,C20,C24,C25,C31,C39,C4,C40,C46,C49,C54,C57,C6,C71,C73,C79,C8,C81,C9
`Chr6:3505699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:3505707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:3508017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:3508071`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A18,A2,A3,B101,B102,B108,B109,B112,B140,B23,B25,B40,B45,B47,B56,B60,B65,B70,B89,B93,B96,C10,C12,C34,C36,C4,C43,C48,C50,C51,C55,C6,C61,C72,C73,C80,D1,D2,D8,D9
`Chr6:3508112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B44,C37,C87,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767694.1

135 aa

135

CENP-S

CENP-T_C

PF15630 CENP-S 19-93 aa PF15511 CENP-T_C 31-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767694.1`	Pfam	`PF15630`	CENP-S	Domain	19	93	4.2e-19	69.4	CENP-S protein
`XP_057767694.1`	Pfam	`PF15511`	CENP-T_C	Domain	31	96	2.9e-10	40.9	Centromere kinetochore component CENP-T histone fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911711.1
GATTGCAGATGTTGATTTTTGAAGCGCGAATTTGAGAGATCGATTAGATGTTGATCAATGCGACTGTCAATCAACTCTTGGAAAAGCTGTGATGAAAAGTCGCATAGCTAATCAGCGACTTCATTTCGTTCCACGAATTCTCCTCTTTATTTTTCCCGCGCAGAATTTGTTCTCCGCAAATTTTCATCAGAATCGAGCGGCAGAGCCCTAGAATTTCGAAATCAAAATCTGTCGGTTGATTTGTCTGAGAGGACAGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987978
ATGGCGAGCGATGTGGAGCGAGGGGAAGAAGAAGAGGAAGAATCGGCCAGCGAGGAGTTGAGGGATCGATTCCGCCTCTGTACCATCTCCATCGCCGAAACTGAAGCGAAGCGAAACGGCATGGAAATTTCCCAGCCAATAATGGCGTGTGTCTCCGATTTAGCCTTCAAATATGCTAAACAGTTGGCAAAAGACCTTGAGTTGTTTGCACAGCATGCTGGTCGCAAGTCTGTGAACATGGAAGACGTCATACTTTCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767694.1
MASDVERGEEEEEESASEELRDRFRLCTISIAETEAKRNGMEISQPIMACVSDLAFKYAKQLAKDLELFAQHAGRKSVNMEDVILSAHRNDHLSASLRSFSNDLKAKEPQSDRKRKKVTKKEDKAAKEVLHIADS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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