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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000429`

染色体: Chr06 坐标: 3535863-3542573 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000429`
名称	SmilChr06G000429
描述	protein BONZAI 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3535863 - 3542573 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987980`
GeneID	`130987980`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987980`
原始查询	`SmilChr06G000429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BONZAI 1
产物	protein BONZAI 1
Arabidopsis	`AT5G61910` (AT5G61910) DCD (Development and Cell Death) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836312] identity=70.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0521300` (OsBON1) - identity=61.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005544 (calcium-dependent phospholipid binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0071277 (cellular response to calcium ion)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF07002 (Copine)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987980

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767697.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057767697.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767697.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767697.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3538591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B28,C12
`Chr6:3539454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B75,C19
`Chr6:3539833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:3540023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C82
`Chr6:3540919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B64,C46
`Chr6:3541218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,C48
`Chr6:3541739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:3541772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767697.1

577 aa

288

577

Copine

PF00168 C2 51-153 aa PF00168 C2 196-289 aa PF07002 Copine 360-575 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767697.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	51	153	1.8e-26	93.1	C2 domain
`XP_057767697.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	196	289	1.8e-26	93.1	C2 domain
`XP_057767697.1`	Pfam	`PF07002`	Copine	Domain	360	575	4.3e-79	265.7	Copine

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911714.1
TGGGCCCCCTCACAGCTGCTACGACCACTGCCTCTGACTCTCTTCTCTCTCTTTCGTCTCTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCCTTTGGAATTCACTGCGCAAACTCTATTTATATTTGCGTTCAACTCAGTAAAATATCTTTACGTAATTTTAGCTTCTACCTTTCTTCTTTTTTCCCCTCCCAATAATTAGGCGACGCCTGCGATGGGGAATTGCTGCTCCGACGTGGCCGGCGGGCAGTCGGCGGTCGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987980
ATGGGGAATTGCTGCTCCGACGTGGCCGGCGGGCAGTCGGCGGTCGGAGGCACCAACTCCAGCCTACCAGCTAACGCTTCCAACGAAGCAGTTGATGCCTTCTTCAAGTCTCGCGGCTACAATGGTCTCTTCTCTCAGATCGAGCTATCTCTCTCTGCAACAGACTTGCGTAATCGGGATGTGCTCTCTAAGAGTGACCCTATGGCGGTTCTGTATATCAAAGGAAGTGATGGTTTGCTACGGGAGCTTGATCGGACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767697.1
MGNCCSDVAGGQSAVGGTNSSLPANASNEAVDAFFKSRGYNGLFSQIELSLSATDLRNRDVLSKSDPMAVLYIKGSDGLLRELDRTEVVLNSLSPKWIKKFTVTYQFEMVQNLVLRVYDVDTPFHGVEVKALKLEEQQLLGEASCTLSELATKLYRTVTVDLAREEASAPAHTRKCGQLIVYAEECVASKTTVELVLRCSDLESKDLFSKSDPFLVISKATEHGILVPICKTEVLKNDHEPKWKQIFLSIQQVGSKDSPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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