当前解析结果
SmilChr06G000430| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000430 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000430 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000430 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 3543820 - 3547451 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987982 |
|---|---|
| GeneID | 130987982 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987982 |
| 原始查询 | SmilChr06G000430 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor IIIB [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827409]; symbol=AT4G17010; hit=AT4G17010; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | transcription factor IIIB [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827409]; symbol=AT4G17010; hit=AT4G17010; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G17010 (AT4G17010)transcription factor IIIB [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827409] identity=57.3; qcov=0.882; evalue=2.39e-55; confidence=high |
| Rice | Os04g0431800 (OSJNBa0084A10.10)- identity=55.2; qcov=0.853; evalue=3.45e-45; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987982 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057767698.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057767698.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057767698.1 |
| 4 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.20000 | XP_057767698.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057767698.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:3546915 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B37,C61 |
Chr6:3547076 |
AAG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A24,B110,B115,B131,C14,C45,C47 |
Chr6:3547114 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,B40,D4 |
Chr6:3547144 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 44 | A1,A13,A4,A5,A7,A9,B118,B120,B121,B122,B123,B134,B19,B24,B28,B30,B31,B34,B5,B54,B6,B65,B68,B74,B78,B85,B88,B94,C18,C24,C29,C30,C37,C45,C50,C59,C64,C66,C67,C80,C83,C86,D1,D7 |
Chr6:3547186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。