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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000435`

染色体: Chr06 坐标: 3566917-3569908 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000435`
名称	SmilChr06G000435
描述	uncharacterized SmilChr06G000435
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3566917 - 3569908 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987988`
GeneID	`130987988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987988`
原始查询	`SmilChr06G000435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231]; symbol=AT1G01630; hit=AT1G01630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231]; symbol=AT1G01630; hit=AT1G01630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G01630` (AT1G01630) Sec14p-like phosphatidylinositol transfer family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839231] identity=56.9; qcov=0.925; evalue=4.02e-104; confidence=high
Rice	`Os03g0850700` - identity=50.8; qcov=0.902; evalue=2.17e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00650 (CRAL_TRIO); PF03765 (CRAL_TRIO_N); PF13716 (CRAL_TRIO_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767708.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057767708.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767708.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767708.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3568286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B66
`Chr6:3568289`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B106,B66
`Chr6:3568289`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B106,B66
`Chr6:3568517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,C23,C75
`Chr6:3568680`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B100,B134,B46
`Chr6:3568680`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B100,B134,B46
`Chr6:3568816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:3568850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:3569717`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B104,B114,B137,B35,B49,B71,B75,B79,B95,C49,C58,C62,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767708.1

266 aa

133

266

CRAL_TRIO_N

CRAL_TRIO

CRAL_TRIO_2

PF03765 CRAL_TRIO_N 57-83 aa PF00650 CRAL_TRIO 109-256 aa PF13716 CRAL_TRIO_2 121-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767708.1`	Pfam	`PF03765`	CRAL_TRIO_N	Domain	57	83	4e-05	24.4	CRAL/TRIO, N-terminal domain
`XP_057767708.1`	Pfam	`PF00650`	CRAL_TRIO	Domain	109	256	2e-36	125.8	CRAL/TRIO domain
`XP_057767708.1`	Pfam	`PF13716`	CRAL_TRIO_2	Domain	121	257	1.3e-12	48.9	Divergent CRAL/TRIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911725.1
TGACTTTTCTGCCTCCTTTGAGCCTTCTTAGTTGCTTATTAACTAAACTGCCTAATAAGTTCTTCCATTATTAACCTGTGACAGAAATTCATCACAGTTTCCAAATTCAATAAACACAACTGCATATAGAAAATCTCCTACATTTCGTCACAATCTTGCTTCAGAATCAAATCCCAGATGGAGAGAACTTTGAAGCAAAAAGAAGAAGACGACATCGAAGAAGAAATATTCTACTCTCCTAATTGTATGGATGAACAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987988
ATGGAGAGAACTTTGAAGCAAAAAGAAGAAGACGACATCGAAGAAGAAATATTCTACTCTCCTAATTGTATGGATGAACAAAATGAAGAGATTCAAAGCAATGATGATGAGGAAAAGAAGAAGATTCATCATTTGAGAGAGATAGTTGCAAAGCAAGACCCAGCTTGCGAGGAAGTAGATGAGGCGACATTGAGAAGATTTCTTCGTGCTCGTGATCTCGACATCGAGAAGGCTTCAACGATGCTGATGAAGTACTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767708.1
MERTLKQKEEDDIEEEIFYSPNCMDEQNEEIQSNDDEEKKKIHHLREIVAKQDPACEEVDEATLRRFLRARDLDIEKASTMLMKYLTWRRNFVPTGSISASEAPNHVAHKKVFMQGRDKRGCPVAVVFGAKHFPCKGNNEEFKRFAVFVLDKICSRIPNGEEKFTIIVDLEGFGYSNSDVRGNIAALSILQNYYPERLKKLFFIHVSYIFMAAWKIVYPFVDKNTRKKITFVENKKLQSALLEEIDVDQLPHIYGGKLQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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