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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G000437

染色体: Chr06 坐标: 3574474-3576521 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G000437
名称SmilChr06G000437
描述uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向3574474 - 3576521 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130987989
GeneID130987989
locus_tag-
NCBI NameLOC130987989
原始查询SmilChr06G000437

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
ArabidopsisAT5G27260 (AT5G27260)
Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]
identity=25.7; qcov=0.453; evalue=2.98e-06; confidence=low
RiceOs02g0328500
-
identity=28.4; qcov=0.495; evalue=7.71e-17; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130987989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057767709.1
2 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057767709.1
3 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057767709.1
4 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057767709.1
5 Telomere 端粒 0.00000 XP_057767709.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057911726.1
CGTGTTTTGTAGGAACGGAAATTTTGTACAATATAGTTAGTGATGGGCCACACTTCACTGGCCCACTCATGATAATTAACATGGGCCATGCGTTTTGTAGGAGCCGAAAATAGGAAGGATTAATTGGGTTCAGCGTTTTGTAGCATACTGTTTACTTATTATACCCATTCAAATTTACCATCTTGTCCCTGGTTTAACTTGGCAAAATACTAGCGTACCCTTCTATTTTTTTCGCAGATATAGTGGCGGGAATATACCTA...
XM_057911727.1
CGTGTTTTGTAGGAACGGAAATTTTGTACAATATAGTTAGTGATGGGCCACACTTCACTGGCCCACTCATGATAATTAACATGGGCCATGCGTTTTGTAGGAGCCGAAAATAGGAAGGATTAATTGGGTTCAGCGTTTTGTAGCATACTGTTTACTTATTATACCCATTCAAATTTACCATCTTGTCCCTGGTTTAACTTGGCAAAATACTAGCGTACCCTTCTATTTTTTTCGCAGATATAGTGGCGGGAATATACCTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC130987989
ATGAGTGAAACGCAACAAGTAGGCAGCAGCGACATCGGTCGTGTGAGGGCATCGAAGCCCGACAAGACACGCCGAAGCTGGACGCCCCGGGAGGAAGAAATGTTGTTGGCCTCGCTCAAGGAACTCGTTGCTCAAGGTTGGAAGGCCGACAATGGGTTTCGAGCTGGCTATCTTTTGAAACTCGAAGAATCTATGCGCAAAGAATTTGTCGGGACTGACATAAAAGGGATGCCGCATATCAATTCCAAGCTTAGCGCGTG...
LOC130987989
ATGAGTGAAACGCAACAAGGCAGCAGCGACATCGGTCGTGTGAGGGCATCGAAGCCCGACAAGACACGCCGAAGCTGGACGCCCCGGGAGGAAGAAATGTTGTTGGCCTCGCTCAAGGAACTCGTTGCTCAAGGTTGGAAGGCCGACAATGGGTTTCGAGCTGGCTATCTTTTGAAACTCGAAGAATCTATGCGCAAAGAATTTGTCGGGACTGACATAAAAGGGATGCCGCATATCAATTCCAAGCTTAGCGCGTGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057767709.1
MSETQQVGSSDIGRVRASKPDKTRRSWTPREEEMLLASLKELVAQGWKADNGFRAGYLLKLEESMRKEFVGTDIKGMPHINSKLSAWKKSYNSLLMALNVSGVGFNAKGTFMLDCDNDQWETIVKKDSNATKMRFKSWPMFEDWKEVFGKDRANGSNAEDVMEAMHKMYAADSLGEVGGNLGQQTGDGLQHHVNEDGEATEDAEDSVCQGEKKVSTARKVSKKRKTGEGEEMNGVYKWLGEISRDTKERLDNLATRVGYE...
XP_057767710.1
MSETQQGSSDIGRVRASKPDKTRRSWTPREEEMLLASLKELVAQGWKADNGFRAGYLLKLEESMRKEFVGTDIKGMPHINSKLSAWKKSYNSLLMALNVSGVGFNAKGTFMLDCDNDQWETIVKKDSNATKMRFKSWPMFEDWKEVFGKDRANGSNAEDVMEAMHKMYAADSLGEVGGNLGQQTGDGLQHHVNEDGEATEDAEDSVCQGEKKVSTARKVSKKRKTGEGEEMNGVYKWLGEISRDTKERLDNLATRVGYEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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