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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000446`

染色体: Chr06 坐标: 3620389-3625451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000446`
名称	SmilChr06G000446
描述	uncharacterized SmilChr06G000446
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3620389 - 3625451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987996`
GeneID	`130987996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987996`
原始查询	`SmilChr06G000446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P0666G10.103; symbol=P0666G10.103; hit=Os08g0538600; species=rice; confidence=high
产物	P0666G10.103; symbol=P0666G10.103; hit=Os08g0538600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G61820` (AT5G61820) stress up-regulated Nod 19 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836304] identity=46; qcov=0.981; evalue=3.79e-125; confidence=high
Rice	`Os08g0538600` (P0666G10.103) - identity=47.6; qcov=0.963; evalue=1.68e-133; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07712 (SURNod19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057767715.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057767715.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767715.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767715.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3620677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C78
`Chr6:3620708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B79,C78
`Chr6:3620771`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C42
`Chr6:3620771`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C42
`Chr6:3620815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr6:3620845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,C44,C45,D8
`Chr6:3620903`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	117	A1,A10,A14,A19,A22,A23,A25,A4,A5,A6,A7,A8,B100,B106,B110,B113,B115,B119,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B130,B131,B132,B137,B139,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B31,B32,B35,B38,B39,B4,B41,B44,B47,B48,B5,B50,B51,B53,B55,B58,B59,B62,B67,B7,B71,B73,B76,B77,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B95,B97,C1,C14,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C26,C3,C30,C31,C33,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C44,C45,C47,C49,C5,C52,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C62,C7,C70,C71,C77,C78,C8,C80,C83,C85,D11,D3,D6,D8
`Chr6:3620913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:3621047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B84,B9
`Chr6:3622492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3622493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B57
`Chr6:3622543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B6,C35,C60,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767715.1

428 aa

214

428

SURNod19

PF07712 SURNod19 30-376 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767715.1`	Pfam	`PF07712`	SURNod19	Domain	30	376	6.2e-146	486.7	Stress up-regulated Nod 19

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911732.1
TATAAATCGCTTAGAAATTTCCTCCTCCTCCTTCGTCTTCTTCTTTTATTAGTTTAATCGTATTATTTATTTAATTTTGTTTCTCTTTCAGCCGTCATCTGCTTCGTTTGCATCCATACTCCCAAGCAGAAAGTCTTACTAATATACGTCGATACTCTAATATATTCTTCCTTCTACAAACCCAAACACTGCACGTTTCTTGATTCTCTCACCACGAAAAATGGCTGCACCTGCAATTGCAAAGCTTGCAATAATCCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987996
ATGGCTGCACCTGCAATTGCAAAGCTTGCAATAATCCTGGTAACAATCCTAGCACATCATCTTCATGAGACTTCGGCAGCGGCCAACGTCGTGAAAACGGAGGTTTTCCGGTCGCCGGAGATAGTGATGGAGCCGGGACTAGTGTCCAACAAGAACTACTACAACATCGAATTCCCACGTGGGCACATCGGGATCAAGGGTTTGAACGCAGAATTAGTCGACGAGAGAGAAAATCCGGTGGCGCTCCACGAGATTTACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767715.1
MAAPAIAKLAIILVTILAHHLHETSAAANVVKTEVFRSPEIVMEPGLVSNKNYYNIEFPRGHIGIKGLNAELVDERENPVALHEIYLHHWVIDRYYARGGDGGDLSIVRNSGICGNGLPQYFGVGAETRRTATDIPHPYGIQVGDPATIPAGYVEGWALNVHAIDTRGAEDKMGCTECRCDLYGGGGGDGGGLHCCPDGSRCRLQQGFHGGKRSIYLRYSVKYVEWDSSSILPLSIYILDVTDHVSTSTATHHCAIEYGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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