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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000450`

染色体: Chr06 坐标: 3646644-3649686 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000450`
名称	SmilChr06G000450
描述	calnexin homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3646644 - 3649686 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988000`
GeneID	`130988000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988000`
原始查询	`SmilChr06G000450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calnexin homolog 1-like
产物	calnexin homolog 1-like
Arabidopsis	`AT5G61790` (CNX1) calnexin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836301] identity=73.4; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0402100` (OsCNX) - identity=75.2; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006457 (protein folding); GO:0030433 (GO:0030433); GO:0051082 (GO:0051082)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00262 (Calreticulin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057767719.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.80000	`XP_057767719.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057767719.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767719.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3647774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C44,D8
`Chr6:3648269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:3648270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:3648276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:3648497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:3648528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr6:3648594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:3648734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:3648748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C40
`Chr6:3648748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr6:3648990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:3649096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B26,B77,C49,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767719.1

538 aa

269

538

Calreticulin

PF00262 Calreticulin 34-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767719.1`	Pfam	`PF00262`	Calreticulin	Family	34	389	5.2e-146	487.0	Calreticulin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911736.1
TGCCCGATCTATATATACAACCCCCTTTGACACGCTCTCCAAATACTGAATAACTATCAAATACTACTAGTCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAGAGTTCTATCTCCCACTCAGATCTATATCTCTCTGATTGCAGCTAAACTTCATTTTGTTCTGTTCTTTGCGGTTAATTTCGGTTGATTCTTACCGGAGTCGAGAGTTCCAAATGGAGTATCCGAATCGGAAGATTTGGATAGTGCAGTGTTTGTTACTATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988000
ATGGAGTATCCGAATCGGAAGATTTGGATAGTGCAGTGTTTGTTACTATTTTCCGCCGCCTGCTTCATTTCTCAGCTCCACGCTTCCGATGATGTGATTTTCTATGAGTCGTTTGATGAGGATTTTGAGGGGAGATGGATCGCGTCTGAGAATCCGGACTACACAGGTGTGTGGAAACATGTGAAGAGTGAGGGACATGATGATCATGGACTTCTTGTTGGGGAGAAAGCCAGGAAGCATGCCATTGTGAAGCCACTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767719.1
MEYPNRKIWIVQCLLLFSAACFISQLHASDDVIFYESFDEDFEGRWIASENPDYTGVWKHVKSEGHDDHGLLVGEKARKHAIVKPLDDPVVLKDKTIVLQFEVRLQNGLECGGAYIKYLRPQDAGWVPKGFDNESPYTIMFGPDRCGATNKVHFILKHKNPKSGNFVEHHLKFPPSVPSDKLTHVYTAILTPDNEVRILVDGEEKKKGNFLSGDDFDPPLIPSKTIPDPDDKKPEDWDERAKIPDPAATKPDDWDEDAPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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