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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000453`

染色体: Chr06 坐标: 3673574-3675178 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000453`
名称	SmilChr06G000453
描述	glutathione S-transferase T3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3673574 - 3675178 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990058`
GeneID	`130990058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990058`
原始查询	`SmilChr06G000453`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T3-like
产物	glutathione S-transferase T3-like
Arabidopsis	`AT5G41220` (GSTT3) glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=25.7; qcov=0.579; evalue=1.91e-14; confidence=low
Rice	`Os08g0225900` - identity=28.7; qcov=0.808; evalue=1.39e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770239.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770239.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770239.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770239.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3673576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:3673581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr6:3673611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:3673643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B43
`Chr6:3673659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C83
`Chr6:3673670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:3673682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B121
`Chr6:3673690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C19,C83
`Chr6:3673703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B75,C18
`Chr6:3673705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr6:3673709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr6:3673721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770239.1

323 aa

162

323

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 166-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770239.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	166	294	4.4e-08	34.8	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914256.1
ATGGATCGTGAATTCGATGAATACCTCGAGCAACAAGGCGGATCGAGGCTTCCAATGATGGGGTTTGCTCCATTTTCACAAGCCTCCAATGTCTTGGCTACGGGAAATGTTCCCACGCCGGCGGCAAACGCCAACGTCCAAGAAGAGCCGGAGGAGGTGAAGCCGAAAGCCAAGGGCACCCGCGCTGCATATTCTAGCGAGGAGTCCGAGCTCGTGGCAATCTTGTGGGCCGAGGCAACCCACAATCCTATTTTGGGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990058
ATGGATCGTGAATTCGATGAATACCTCGAGCAACAAGGCGGATCGAGGCTTCCAATGATGGGGTTTGCTCCATTTTCACAAGCCTCCAATGTCTTGGCTACGGGAAATGTTCCCACGCCGGCGGCAAACGCCAACGTCCAAGAAGAGCCGGAGGAGGTGAAGCCGAAAGCCAAGGGCACCCGCGCTGCATATTCTAGCGAGGAGTCCGAGCTCGTGGCAATCTTGTGGGCCGAGGCAACCCACAATCCTATTTTGGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770239.1
MDREFDEYLEQQGGSRLPMMGFAPFSQASNVLATGNVPTPAANANVQEEPEEVKPKAKGTRAAYSSEESELVAILWAEATHNPILGTSQKLLQYWGAIAEKFNVLNTSGAPPRKPDHLKSHFARIQKETKFFEGFYNTCKDNWGSGMSDDQIFQQAHTMFEANFKKQFSYVKAWKVLRECQRFTSQAGDVHSAKKSKGSDGGATTTSSDPSVMTRPQGQKAAKRDKGKAKKGEGSSGGGSTFSDALEKVAESMREHALKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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