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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G000457

染色体: Chr06 坐标: 3687851-3695392 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G000457
名称SmilChr06G000457
描述uncharacterized SmilChr06G000457
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向3687851 - 3695392 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130988011
GeneID130988011
locus_tag-
NCBI NameLOC130988011
原始查询SmilChr06G000457

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830629]; symbol=AT5G07380; hit=AT5G07380; species=arabidopsis; confidence=high
产物uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830629]; symbol=AT5G07380; hit=AT5G07380; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT5G07380 (AT5G07380)
uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830629]
identity=45.2; qcov=1; evalue=2.19e-166; confidence=high
RiceOs01g0103900
-
identity=43.7; qcov=0.717; evalue=1.29e-117; confidence=medium
GO-
KEGG-
PfamPF29334 (M1AP_C)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130988011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057767734.1
2 Chromosome 染色体 1.00000 XP_057767735.1
3 Nucleoplasm 核质 1.00000 XP_057767737.1
4 Nuclear body 核内小体 0.80000 XP_057767737.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057767734.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:3688236 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B122
Chr6:3688308 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B44
Chr6:3688326 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B113,B132,D10
Chr6:3688330 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B137,B35,B40
Chr6:3689488 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 C44,D8
Chr6:3689489 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C24
Chr6:3690064 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A9
Chr6:3690895 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A15,B84,B9
Chr6:3690930 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B130,B64,C13,C29
Chr6:3691020 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C82
Chr6:3691053 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B84
Chr6:3691650 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767734.1
663 aa
N
1
332
663
M1AP_C
C
PF29334 M1AP_C 329-485 aa
XP_057767735.1
661 aa
N
1
330
661
M1AP_C
C
PF29334 M1AP_C 327-483 aa
XP_057767736.1
657 aa
N
1
328
657
M1AP_C
C
PF29334 M1AP_C 323-479 aa
XP_057767737.1
600 aa
N
1
300
600
M1AP_C
C
PF29334 M1AP_C 266-422 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057767734.1 Pfam PF29334 M1AP_C Domain 329 485 1.1e-20 74.9 Meiosis 1 arrest protein C-terminal domain
XP_057767735.1 Pfam PF29334 M1AP_C Domain 327 483 1.1e-20 74.9 Meiosis 1 arrest protein C-terminal domain
XP_057767736.1 Pfam PF29334 M1AP_C Domain 323 479 1.1e-20 74.9 Meiosis 1 arrest protein C-terminal domain
XP_057767737.1 Pfam PF29334 M1AP_C Domain 266 422 9.3e-21 75.1 Meiosis 1 arrest protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA
XR_009089952.1
TGCGAGTTCCGACTCTTATAAATAAATCCGGAGAAATCTCACTCTCAAAATTTATTAGCCAAAAAGGAAAATAAACTGAGTGACAAAATGGTGCTGCTCTGCTTCGTATTGGATTTGCGGAGCTTATCGCCTCCAGTTCTTCGAGATCTGAAGCAGTCATTGTTGCAGCTTGCAAATTACTACGCAGTTTCGAGTCCGAAGGTTGATTATTGTGTTGACGGAACTCAATCGAATTCGAAGCCTCTGCCTGACCGGATTGG...
XM_057911751.1
TGCGAGTTCCGACTCTTATAAATAAATCCGGAGAAATCTCACTCTCAAAATTTATTAGCCAAAAAGGAAAATAAACTGAGTGACAAAATGGTGCTGCTCTGCTTCGTATTGGATTTGCGGAGCTTATCGCCTCCAGTTCTTCGAGATCTGAAGCAGTCATTGTTGCAGCTTGCAAATTACTACGCAGTTTCGAGTCCGAAGGTTGATTATTGTGTTGACGGAACTCAATCGAATTCGAAGCCTCTGCCTGACCGGATTGG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
LOC130988011
ATGGTGCTGCTCTGCTTCGTATTGGATTTGCGGAGCTTATCGCCTCCAGTTCTTCGAGATCTGAAGCAGTCATTGTTGCAGCTTGCAAATTACTACGCAGTTTCGAGTCCGAAGGTTGATTATTGTGTTGACGGAACTCAATCGAATTCGAAGCCTCTGCCTGACCGGATTGGACTGTGCTATATCGTGCGGAACCGAATTACTTGTTCCGATGAGCTGAAGATTGCATATAATCCCCAAGGAAAGTTCAGCTTACGCGA...
LOC130988011
ATGGTGCTGCTCTGCTTCGTATTGGATTTGCGGAGCTTATCGCCTCCAGTTCTTCGAGATCTGAAGCAGTCATTGTTGCAGCTTGCAAATTACTACGCAGTTTCGAGTCCGAAGGTTGATTATTGTGTTGACGGAACTCAATCGAATTCGAAGCCTCTGCCTGACCGGATTGGACTGTGCTATATCGTGCGGAACCGAATTACTTGTTCCGATGAGCTGAAGATTGCATATAATCCCCAAGGAAAGTTCAGCTTACGCGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057767734.1
MVLLCFVLDLRSLSPPVLRDLKQSLLQLANYYAVSSPKVDYCVDGTQSNSKPLPDRIGLCYIVRNRITCSDELKIAYNPQGKFSLRDLHRALNNLPLDTFCPESNDSEGICKDLKLADVLSEKTVYTWGGQDKTVKRKVILISSSLVGALDPVTMKALTDAADKCVLVEFILLEQTSSQLSNNSENVNQFVKQIGSLTNCSFQTCVPGLQVLYGLGKRWFQELKDDKDVPLQAHFIFKSSLMSSCNQISCNLCVSFNPTV...
XP_057767735.1
MVLLCFVLDLRSLSPPVLRDLKQSLLQLANYYAVSSPKVDYCVDGTQSNSKPLPDRIGLCYIVRNRITCSDELKIAYNPQGKFSLRDLHRALNNLPLDTFCPESNDSEGIYLKLADVLSEKTVYTWGGQDKTVKRKVILISSSLVGALDPVTMKALTDAADKCVLVEFILLEQTSSQLSNNSENVNQFVKQIGSLTNCSFQTCVPGLQVLYGLGKRWFQELKDDKDVPLQAHFIFKSSLMSSCNQISCNLCVSFNPTVDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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