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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000458`

染色体: Chr06 坐标: 3695817-3705166 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000458`
名称	SmilChr06G000458
描述	respiratory burst oxidase homolog protein C-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3695817 - 3705166 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988009`
GeneID	`130988009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988009`
原始查询	`SmilChr06G000458`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	respiratory burst oxidase homolog protein C-like
产物	respiratory burst oxidase homolog protein C-like
Arabidopsis	`AT5G51060` (RHD2) NADPH/respiratory burst oxidase protein D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835179] identity=66.5; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0360200` (RBOHB) - identity=56.1; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0016174 (NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01794 (Ferric_reduct); PF08022 (FAD_binding_8); PF08030 (NAD_binding_6); PF08414 (NADPH_Ox)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057767732.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767732.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767732.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767732.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3696195`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A1,A18,A20,A3,B105,B119,B12,B126,B140,B16,B25,B35,B53,B62,B72,B84,C16,C24,C3,C39,C44,C56,C67,C83,D7,D9
`Chr6:3697542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B84,B9
`Chr6:3697616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:3697701`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A1,A18,A20,A3,B105,B114,B119,B12,B126,B140,B16,B25,B35,B49,B51,B53,B6,B62,B81,B84,B87,B93,C16,C20,C24,C3,C39,C42,C44,C56,C67,C70,C83,C86,D1,D7,D9
`Chr6:3697710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B64,C13,C29
`Chr6:3697734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A1,A18,A20,A3,B105,B114,B119,B12,B126,B16,B25,B35,B49,B51,B53,B6,B62,B81,B84,B87,B93,C16,C20,C24,C3,C39,C42,C44,C56,C70,C83,C86,D1,D7,D9
`Chr6:3697743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C23,C82
`Chr6:3697747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:3697767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C78,D6
`Chr6:3697769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr6:3697780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C55
`Chr6:3697788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B64,C13,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767732.1

934 aa

467

934

NADPH_Ox

Ferric_reduct

FAD_binding_8

NAD_binding_6

PF08414 NADPH_Ox 146-247 aa PF01794 Ferric_reduct 413-561 aa PF08022 FAD_binding_8 605-721 aa PF08030 NAD_binding_6 728-916 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767732.1`	Pfam	`PF08414`	NADPH_Ox	Family	146	247	3.3e-40	137.2	Respiratory burst NADPH oxidase
`XP_057767732.1`	Pfam	`PF01794`	Ferric_reduct	Domain	413	561	1.6e-11	45.1	Ferric reductase like transmembrane component
`XP_057767732.1`	Pfam	`PF08022`	FAD_binding_8	Domain	605	721	2.6e-37	128.0	FAD-binding domain
`XP_057767732.1`	Pfam	`PF08030`	NAD_binding_6	Domain	728	916	2.7e-48	164.7	Ferric reductase NAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911749.1
GGATGATCAAACACTTAACAATCAATTCCTGCCAAATAGATCGCAATCTCGATTATGGGTTGATTGATTAGTGGAAATTGTGTCGCTTAGTTACTTAACGGAAATATTATTAATGCGTCTCAAACAGTAATTCAACATATATATGCAACAAAAGAGACATCAAAACTTTATTATGTGTATAAATTCAGTGCCTAGCTCATACTCACAAATTATAACTACAAAATCCCACATGAAAAACAAGGAAGGAATCCACCACCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988009
ATGCAACAAAAGAGACATCAAAACTTTATTATGTGTATAAATTCAGTGCCTAGCTCATACTCACAAATTATAACTACAAAATCCCACATGAAAAACAAGGAAGGAATCCACCACCGCCACTACTCCGACGACGCCGGCGGCGGCGGCGGAGGCAAGAAGAGCGCGCGTTTCACCCTCCCCGACGTCGACAGCCCCGCCTCCGCGGCGGAGGACTACGTCGAGATCACCCTCGACCTGCACGAGGACTCGGTGGCGGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767732.1
MQQKRHQNFIMCINSVPSSYSQIITTKSHMKNKEGIHHRHYSDDAGGGGGGKKSARFTLPDVDSPASAAEDYVEITLDLHEDSVAVHSVTAAGGGAVEDPELKILAKGLEKKSSFGSTAARSASTRIRQELKRLASLTRHPQPVKRLDRTKSAAAQALKGLKFISKADGGAAWSAVEKRFHELTSTAANGMLPRSLFGECIGMKGSKEFAGELFDALSRRRNISGDSITREQLKDFWDQIADQSFDSRLKTFFDMVDKDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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