当前解析结果
SmilChr06G000463| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000463 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000463 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000463 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 3789794 - 3792165 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988016 |
|---|---|
| GeneID | 130988016 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988016 |
| 原始查询 | SmilChr06G000463 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0603400; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os04g0603400; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G43150 (AT5G43150)elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834332] identity=46.4; qcov=0.602; evalue=6.46e-13; confidence=low |
| Rice | Os04g0603400- identity=59.2; qcov=0.763; evalue=1.21e-23; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988016 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057767741.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057767741.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057767741.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767741.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767741.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:3790024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr6:3791764 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B130,B19,B64,C13,C29 |
Chr6:3791794 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B102,B47,D8 |
Chr6:3791803 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:3791811 |
A |
ATG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B101 |
Chr6:3791811 |
A |
ATG |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr6:3791816 |
CAG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B101 |
Chr6:3791816 |
CAG |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr6:3791842 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,B98 |
Chr6:3791915 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B112 |
Chr6:3791915 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr6:3791918 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B112 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。