当前解析结果
SmilChr06G000471| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000471 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000471 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000471 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 3843906 - 3845716 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988025 |
|---|---|
| GeneID | 130988025 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988025 |
| 原始查询 | SmilChr06G000471 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0266200; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os08g0266200; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G79660 (AT1G79660)ephrin-A3 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844305] identity=50; qcov=1; evalue=1.28e-27; confidence=medium |
| Rice | Os08g0266200- identity=53.9; qcov=1; evalue=3.49e-28; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988025 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057767751.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057767751.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057767751.1 |
| 4 | Nucleus inner membrane | Nucleus inner membrane | 0.40000 | XP_057767751.1 |
| 5 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057767751.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:3845212 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,B69 |
Chr6:3845308 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr6:3845410 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B96,C53,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。