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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000476`

染色体: Chr06 坐标: 3876372-3878096 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000476`
名称	SmilChr06G000476
描述	aspartyl protease family protein At5g10770
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	3876372 - 3878096 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988030`
GeneID	`130988030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988030`
原始查询	`SmilChr06G000476`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease family protein At5g10770
产物	aspartyl protease family protein At5g10770
Arabidopsis	`AT1G79720` (AT1G79720) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844311] identity=57.1; qcov=1.02; evalue=1.47e-178; confidence=high
Rice	`Os09g0423500` - identity=51.2; qcov=0.958; evalue=3.91e-145; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057767760.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767760.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767760.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767760.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:3876588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B15,C14,C50,C76
`Chr6:3876669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:3876701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C61
`Chr6:3876828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:3876957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:3877011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:3877172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C47,C57
`Chr6:3877292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr6:3877377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:3877500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:3877594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D3
`Chr6:3877651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767760.1

451 aa

226

451

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 104-272 aa PF00026 Asp 104-445 aa PF14541 TAXi_C 298-445 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767760.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	104	272	1e-50	173.1	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057767760.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	104	445	9.3e-22	78.6	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057767760.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	298	445	6.8e-26	91.7	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911777.1
AAACAATGCTGCTTCTCCTCATTCTCGTTGCCTGCAGTTGCTCCAATGGGGTCTTGAGCCTTGCCGAGAAGGAGCTTCTCTCGCTCAAACGGCTTCCAACGGCGCCCGCCCCGCCCCGCTTCTTGCACAAATCAAAGAGTGGTGCAACCATACTGGAAATGAGGCACAGGAAGCACCTCCAGAAAGGGCTGATTCTTGATGATGTTCGAGTTGAATCCATTCAATCGCGAATCAAGAACATCGTCTCCGGCCATGTAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988030
ATGCTGCTTCTCCTCATTCTCGTTGCCTGCAGTTGCTCCAATGGGGTCTTGAGCCTTGCCGAGAAGGAGCTTCTCTCGCTCAAACGGCTTCCAACGGCGCCCGCCCCGCCCCGCTTCTTGCACAAATCAAAGAGTGGTGCAACCATACTGGAAATGAGGCACAGGAAGCACCTCCAGAAAGGGCTGATTCTTGATGATGTTCGAGTTGAATCCATTCAATCGCGAATCAAGAACATCGTCTCCGGCCATGTAGAATCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767760.1
MLLLLILVACSCSNGVLSLAEKELLSLKRLPTAPAPPRFLHKSKSGATILEMRHRKHLQKGLILDDVRVESIQSRIKNIVSGHVESSQARVPISSGIKLQTLNYIVTVTLGSRNLTVIVDTGSDLSWVQCQPCRLCYTQPEPLFNPLVSPSYRSVQCNSQPCQTLQSNTGNSGLCGSNAPRCNYAVTYGDGSYTRGELGRDRLTLGTTPVEDFVFGCGRNNRGLFGAASGLMGLGRSDLSLISQTSDVFGAVFSYCLPDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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