当前解析结果
SmilChr06G000499| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000499 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000499 |
| 描述 | glycine-rich protein 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 4100519 - 4101076 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990063 |
|---|---|
| GeneID | 130990063 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990063 |
| 原始查询 | SmilChr06G000499 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich protein 5-like |
| 产物 | glycine-rich protein 5-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990063 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057770244.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057770244.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770244.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770244.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770244.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:4100607 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B140,C41 |
Chr6:4100607 |
ATT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B140,C41 |
Chr6:4100698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr6:4100798 |
TCC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A10,A21,A24,A3,A8,B106,B126,B41,B89,C40,C66,C70,C81,D10,D2 |
Chr6:4100937 |
ACG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 33 | A22,B1,B109,B110,B118,B13,B137,B16,B24,B34,B37,B44,B53,B67,B68,B69,B77,B93,B99,C13,C14,C17,C30,C32,C34,C41,C48,C51,C55,C59,C61,C63,C68 |
Chr6:4101059 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr6:4101075 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 48 | A1,A18,A2,A20,A25,B105,B107,B109,B112,B115,B129,B13,B130,B131,B135,B138,B15,B20,B25,B27,B35,B38,B39,B42,B43,B49,B5,B50,B60,B61,B64,B88,B95,B98,C1,C12,C23,C25,C29,C33,C4,C5,C53,C54,C79,D2,D3,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。