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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000503`

染色体: Chr06 坐标: 4166632-4168236 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000503`
名称	SmilChr06G000503
描述	spermidine hydroxycinnamoyl transferase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4166632 - 4168236 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988054`
GeneID	`130988054`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988054`
原始查询	`SmilChr06G000503`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	spermidine hydroxycinnamoyl transferase-like
产物	spermidine hydroxycinnamoyl transferase-like
Arabidopsis	`AT2G19070` (SHT) spermidine hydroxycinnamoyl transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816424] identity=43.5; qcov=1.01; evalue=3.79e-136; confidence=medium
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=36; qcov=1.03; evalue=9.19e-97; confidence=medium
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00941 (Flavonoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00945 (Stilbenoid, diarylheptanoid and gingerol biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988054

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767795.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767795.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767795.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767795.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4166785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B67,C22,C44,C8
`Chr6:4166910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:4166970`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D9
`Chr6:4166970`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D9
`Chr6:4167054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:4167192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr6:4167241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B103,B51
`Chr6:4167362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B40,B44
`Chr6:4167385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B103,B51
`Chr6:4167397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr6:4167483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B2,B35,C8,D2
`Chr6:4167496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,C27,C56,C65,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767795.1

443 aa

222

443

Transferase

PF02458 Transferase 1-441 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767795.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	1	441	1.9e-96	324.1	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911812.1
GAAAAAGTCCATATTCCTCCACAAAGATTATCATAATATTCTACAATAACCAACCCAACAACACTTAATATTTTCTCTATATAATTAAACTCTGCATAACATGCATATCTATCTAATCTAAACCCTTCCATTCTAGTGTGCGTGATGGTGACCGTGAAAGCCACCCACATTGTCCGGCCGGCGGAGGCACGGCCGGACGAGATCATGTACATAAATTCATGCGATCAAATCAAAGACATAACCCACACTCCCACACTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988054
ATGGTGACCGTGAAAGCCACCCACATTGTCCGGCCGGCGGAGGCACGGCCGGACGAGATCATGTACATAAATTCATGCGATCAAATCAAAGACATAACCCACACTCCCACACTCTACTTGTACAATCACTCCGCCGCTTTGGAGGCCGCGAACGCCGTCTCCATACTCAAACACTCCCTCAGCAAAGCCCTAGCGCTCTTCTACCCGCTTGCCGGCCGCCTGCGCTGGGCGGAGGCGGGCGGCAGCAGGGTGGAGCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767795.1
MVTVKATHIVRPAEARPDEIMYINSCDQIKDITHTPTLYLYNHSAALEAANAVSILKHSLSKALALFYPLAGRLRWAEAGGSRVELHCNGEGVPIFEAESDAAIEDLGDFTPTQAIQPLIPSVDYTTPLHQIPMVIVQLTRFRCGGLGLGLGISHVMADGPSALHFITEWTKFARGAGPVAPPFLDRKVVDADQPPASFDFDPAVLRRPPTLIGEEDSLEQRRKPIAAAVLGLSKLQIEKLRRKADLDNVSRGYSRFEAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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