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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000506`

染色体: Chr06 坐标: 4177671-4181644 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000506`
名称	SmilChr06G000506
描述	uncharacterized SmilChr06G000506
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4177671 - 4181644 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990064`
GeneID	`130990064`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990064`
原始查询	`SmilChr06G000506`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=37.5; qcov=0.182; evalue=1.1e-14; confidence=weak
Rice	`Os11g0672600` - identity=33.1; qcov=0.472; evalue=1.21e-37; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990064

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770246.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770246.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770246.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770246.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4177676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B19,B58,B94,D8
`Chr6:4177711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B131,C17
`Chr6:4177729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B69,B86,C29
`Chr6:4177758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B65,B84
`Chr6:4177888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr6:4179549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr6:4179558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B114,B138,B76
`Chr6:4179633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B125,B15,C72,C82
`Chr6:4179636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C3,C86
`Chr6:4179660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C19,C68
`Chr6:4179664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr6:4179733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770246.1

615 aa

308

615

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 97-330 aa PF13966 zf-RVT 492-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770246.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	97	330	2.4e-24	87.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057770246.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	492	586	5.9e-18	66.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914263.1
ATGGACAAGCCGCCTTCTGATGGAGGCCGAGCTTCAGATGCTTGCATCCCTCAGGACAGTCAGGGTAGAAAGGATATGGAACACCCTGGGTCAGATGACGAAAAGAGCCAAATTGAGGTAGTTGAGCAGGAACACGAGAGGAGTTCTGCACCTCTGGTTGTTCAGCCGCTTGCTGTTATGACTGACAACAACGCTGTGCTAACTTTGACTGGGACGACAGGACCCATTTCTCAATTCTACCGAAACGGGAAGATCCCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990064
ATGGACAAGCCGCCTTCTGATGGAGGCCGAGCTTCAGATGCTTGCATCCCTCAGGACAGTCAGGGTAGAAAGGATATGGAACACCCTGGGTCAGATGACGAAAAGAGCCAAATTGAGGTAGTTGAGCAGGAACACGAGAGGAGTTCTGCACCTCTGGTTGTTCAGCCGCTTGCTGTTATGACTGACAACAACGCTGTGCTAACTTTGACTGGGACGACAGGACCCATTTCTCAATTCTACCGAAACGGGAAGATCCCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770246.1
MDKPPSDGGRASDACIPQDSQGRKDMEHPGSDDEKSQIEVVEQEHERSSAPLVVQPLAVMTDNNAVLTLTGTTGPISQFYRNGKIPRGGNPSFIVLIPKKEGAISLDDFRPISLISSLYKVIAKILANRMKGVMDSIISDNQSAFISGRFILDGVAYDFVEWDYLDVMLDRFNFDSRWRKLIRGCLTSASANVLVNGSPSGEFSLEKGLRQGDPLSPFLFLIAAEGLHSLVERAVEKGFVGPAEIGKDNIRISHLQYADD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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