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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000519`

染色体: Chr06 坐标: 4281287-4284611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000519`
名称	SmilChr06G000519
描述	F-box protein SKIP1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4281287 - 4284611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988065`
GeneID	`130988065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988065`
原始查询	`SmilChr06G000519`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein SKIP1
产物	F-box protein SKIP1
Arabidopsis	`AT5G57900` (SKIP1) SKP1 interacting partner 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835901] identity=56.7; qcov=0.983; evalue=3.74e-119; confidence=high
Rice	`Os08g0269800` (OsFbox432) - identity=42.1; qcov=0.416; evalue=5.21e-26; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767810.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057767810.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057767810.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767810.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4282547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:4282630`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A14
`Chr6:4282630`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A14
`Chr6:4282635`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A2,B40
`Chr6:4282635`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A2,B40
`Chr6:4282756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:4282767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:4282841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B93
`Chr6:4282885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:4282960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B122
`Chr6:4284335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767810.1

303 aa

152

303

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 11-52 aa PF12937 F-box-like 16-51 aa

XP_057767811.1

303 aa

152

303

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 11-52 aa PF12937 F-box-like 16-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767810.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	11	52	7e-08	32.8	F-box domain
`XP_057767810.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	16	51	1.3e-07	32.0	F-box-like
`XP_057767811.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	11	52	7e-08	32.8	F-box domain
`XP_057767811.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	16	51	1.3e-07	32.0	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911827.1
GATTCCATCGGCATCCGCTCTCTTAGAAATGGATGAGGAGAGTGCAACCGCCGCCGATTGGGCCGACTTGACTCACGAGTGCCTCCTCAACATCCTCCGCCGCCTCTCCCTCGAGGACCGATGGCGGGGAGCCATGCGCGTCTGCAAGTCGTGGCATCAAGCGTGTAAGGATCCCTGCCTCAATTCCGTAATCGACATCGAATCTCATTTCGGCTCTGCCAACGAATTGCCCCGCTTCTGGACTCCGGAGTTCGAGCGGA...

XM_057911828.1
CAAAGTGTAATAGATTCCATCGGCATCCGCTCTCTTAGAAATGGATGAGGAGAGTGCAACCGCCGCCGATTGGGCCGACTTGACTCACGAGTGCCTCCTCAACATCCTCCGCCGCCTCTCCCTCGAGGACCGATGGCGGGGAGCCATGCGCGTCTGCAAGTCGTGGCATCAAGCGTGTAAGGATCCCTGCCTCAATTCCGTAATCGACATCGAATCTCATTTCGGCTCTGCCAACGAATTGCCCCGCTTCTGGACTCCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988065
ATGGATGAGGAGAGTGCAACCGCCGCCGATTGGGCCGACTTGACTCACGAGTGCCTCCTCAACATCCTCCGCCGCCTCTCCCTCGAGGACCGATGGCGGGGAGCCATGCGCGTCTGCAAGTCGTGGCATCAAGCGTGTAAGGATCCCTGCCTCAATTCCGTAATCGACATCGAATCTCATTTCGGCTCTGCCAACGAATTGCCCCGCTTCTGGACTCCGGAGTTCGAGCGGAGGGTCGATAATATGCTCCGATCCGTTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767810.1
MDEESATAADWADLTHECLLNILRRLSLEDRWRGAMRVCKSWHQACKDPCLNSVIDIESHFGSANELPRFWTPEFERRVDNMLRSVVLWSSGGLTQIRVRHCSDRSLDLVAKRCPNLQVLSIQSSPHVTDAIMAEIASGCPKIKELDVSYCYEISDKSLAVIGFHCPNMHMLKRNLMNWLDPSQHAGVVPYEYLNACPQDGDSEAAAISKFMPNLLHLELRFLKLTAKGVTLISEGCKDLEYIDLSGCANVTSRDIACAS...

XP_057767811.1
MDEESATAADWADLTHECLLNILRRLSLEDRWRGAMRVCKSWHQACKDPCLNSVIDIESHFGSANELPRFWTPEFERRVDNMLRSVVLWSSGGLTQIRVRHCSDRSLDLVAKRCPNLQVLSIQSSPHVTDAIMAEIASGCPKIKELDVSYCYEISDKSLAVIGFHCPNMHMLKRNLMNWLDPSQHAGVVPYEYLNACPQDGDSEAAAISKFMPNLLHLELRFLKLTAKGVTLISEGCKDLEYIDLSGCANVTSRDIACAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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