当前解析结果
SmilChr06G000520| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000520 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000520 |
| 描述 | UPF0057 membrane protein At2g24040-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 4287101 - 4287676 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988066 |
|---|---|
| GeneID | 130988066 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988066 |
| 原始查询 | SmilChr06G000520 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UPF0057 membrane protein At2g24040-like |
| 产物 | UPF0057 membrane protein At2g24040-like |
| Arabidopsis | AT4G28088 (AT4G28088)Low temperature and salt responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745729] identity=73; qcov=0.9; evalue=2.17e-27; confidence=medium |
| Rice | Os09g0558100 (OsRCI2-11)- identity=65.7; qcov=0.957; evalue=1.86e-25; confidence=medium |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01679 (Pmp3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988066 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057767812.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057767812.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767812.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767812.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767812.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767812.1PF01679
Pmp3 7-54 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767812.1 |
Pfam | PF01679 |
Pmp3 | Family | 7 | 54 | 1.5e-19 | 70.5 | Proteolipid membrane potential modulator |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。