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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000524`

染色体: Chr06 坐标: 4313327-4316086 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000524`
名称	SmilChr06G000524
描述	uncharacterized SmilChr06G000524
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4313327 - 4316086 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990068`
GeneID	`130990068`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990068`
原始查询	`SmilChr06G000524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=24; qcov=0.403; evalue=5.13e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990068

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770251.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770251.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770251.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770251.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770251.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4313337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B104,B125
`Chr6:4313383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B23,B71
`Chr6:4313384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr6:4313389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B108,B69
`Chr6:4313452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr6:4313461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A14,A23,A5,B107,B109,B110,B138,B32,B54,C32,C42,C5,C61,C62,C73,D1
`Chr6:4313462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C43
`Chr6:4313472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B59,B80,C33,C43
`Chr6:4313476`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B27,B59,B80,C43
`Chr6:4313476`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B27,B59,B80,C43
`Chr6:4313526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:4313608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770251.1

476 aa

238

476

DUF8566

DUF1985

PF29561 DUF8566 54-214 aa PF09331 DUF1985 80-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770251.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	54	214	4.2e-09	37.2	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057770251.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	80	210	6.3e-17	62.6	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914268.1
CACATATTGATTCTCATTTGACCGCTTTATTGAGAACAGTAGTTGGTAGATAGATTTGTCATTACTATGTCTGAATTTGAATTGCCCCTAAATTGCTCACTCCATTTCGTCCGCATAGTTGTGGTGTTTTGCGCGATTTAATTTCCCTTTCATTCCCAAATCCTTGCCATTTCATTTCTTGCTTCCTTGAAACCTAGAGCAACGGACTTATTTTCATTTCAGACGACGTTGGAGATTATGGCCGCAGTTGAAGAGGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990068
ATGGCCGCAGTTGAAGAGGGGGCTCTATTGAGACCAAGCACTATTAATGTAACTTCGGACGTTGGCACTTATTATAAAATCAAGTATTTAGACAAAGTGAAGAAAAATTTAAAGGATAAAGGTGGTGAACAATTGTTAAATAGATTTTTACGGGGTTGTTTTGGACATTTATTGGATTGGAATCCTGGTCCGAAATGTGCAATGGCCATTCATCAAGTAGTCTCTCACCAAATAAAGTCAAGCCGTGATGGCCTTTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770251.1
MAAVEEGALLRPSTINVTSDVGTYYKIKYLDKVKKNLKDKGGEQLLNRFLRGCFGHLLDWNPGPKCAMAIHQVVSHQIKSSRDGLFFLLNNTRVHFSKRDYALVTGLNFGDFNVDMSRNHDLSGVEVFNKFNCGESHVKLSTLIDLFENFEIDDEDGSLYLRIAYIIVLYGMLVGYETDKTIEHWVWALVDDLDAFNQFPWGAYTYNLLCYYTTNSSNVVCNCVAEFAHPKCLKWKFRSRPATKDLRPFFEKEEQELLEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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