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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000538`

染色体: Chr06 坐标: 4499035-4500893 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000538`
名称	SmilChr06G000538
描述	uncharacterized SmilChr06G000538
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4499035 - 4500893 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988082`
GeneID	`130988082`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988082`
原始查询	`SmilChr06G000538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0128300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0128300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0128300` - identity=32.6; qcov=0.196; evalue=2.7e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988082

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767822.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767822.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767822.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767822.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057767822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4499267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B20,C58
`Chr6:4499279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:4499315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A14,A19,A24,A7,B100,B101,B128,B129,B131,B133,B23,B37,B49,B74,B79,B80,C11,C51,C69,C7,C72,C75,C76,C78
`Chr6:4499343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:4499346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D2,D9
`Chr6:4499351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C50
`Chr6:4499353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D2,D9
`Chr6:4499388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B9,C48,C61
`Chr6:4499399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr6:4499412`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A3,B103,B132,B86,C18,C25,C39,C49,C9,D5
`Chr6:4499428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B71,B81,C62
`Chr6:4499441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767822.1

454 aa

227

454

Transpos_assoc

Transposase_24

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa PF03004 Transposase_24 238-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767822.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	7.6e-18	65.2	Transposase-associated domain
`XP_057767822.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	238	358	3.5e-13	50.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911839.1
TTTGTTTTTTTCAATTAGAATTTGCAAGAATGAGTGATAATCGTATGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTCTTGCATTTGAAATGGGACTTGAGACTTTCCTTGAGTACGCAAGAAATCAAACGGCGTACACAGATGGAGAGGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAAGCGTATTTGGATGTACCTACAGTCAGAAAACATGTTGGTAGGTGTGGATTTGTTCTGAATTACACAAATTGGGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988082
ATGAGTGATAATCGTATGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTCTTGCATTTGAAATGGGACTTGAGACTTTCCTTGAGTACGCAAGAAATCAAACGGCGTACACAGATGGAGAGGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAAGCGTATTTGGATGTACCTACAGTCAGAAAACATGTTGGTAGGTGTGGATTTGTTCTGAATTACACAAATTGGGTTTCTCACGGGGAAGCACGACTGTATATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767822.1
MSDNRMWMYARYNDRLAFEMGLETFLEYARNQTAYTDGEGNIRCPCKKCKNQAYLDVPTVRKHVGRCGFVLNYTNWVSHGEARLYMPTADGSGPLVSGTPETLEVGTTSRAKRPKGPTATQIRARSAIDGGRIWFERDATGKLMEPLGLSKACTASFKRFDNPGGYTWKKTHPDIKTAYFNELRKEFSWAPEDEKEVRDMWEKNARKRYFDMISEYKSDLMKSLDRGKEMSRPAWMSPEFWTGLQEYWQSPEAQALSARA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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