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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000541`

染色体: Chr06 坐标: 4510855-4515389 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000541`
名称	SmilChr06G000541
描述	transmembrane 9 superfamily member 9-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4510855 - 4515389 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988086`
GeneID	`130988086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988086`
原始查询	`SmilChr06G000541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 9-like
产物	transmembrane 9 superfamily member 9-like
Arabidopsis	`AT5G25100` (AT5G25100) Endomembrane protein 70 protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832581] identity=78.8; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0554900` - identity=79.2; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057767826.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057767826.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057767826.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057767826.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057767826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4511061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr6:4511070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B51,C78
`Chr6:4511142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A23,B33,B68,C50
`Chr6:4511168`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B139,B45,B89,C10,C72
`Chr6:4511168`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B139,B45,B89,C10,C72
`Chr6:4511177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B98
`Chr6:4511370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B57,C46,D10
`Chr6:4511515`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr6:4511515`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr6:4511548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B9,C48,C61
`Chr6:4511554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,B94
`Chr6:4511725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767826.1

641 aa

320

641

EMP70

PF02990 EMP70 60-597 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767826.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	60	597	5.1e-221	735.5	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911843.1
ACCCCACCCGGAGAGCACTTTTTAGAAGAGATAAACTATGCCAAGCACGAATCCAGACAAAAAAATAATTTAAGAATATATTGCGATTATTATTCTGCAAAAAGAAGCTTAGCTTATAGTTGTAAGTCAATACGTAGTCGGATCACCCTTATTTTGCCTCCGTTTTCCTCTCTCGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTCACACACAGAGTGGGAGAGGCCATCTAATTGGACTTGGATCTTCGATCGGCTGTTGATCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988086
ATGGAGGTCATCGGGCGAAGGTCTCACGCGATTCAGATGTGTATGTACATCACGCTCTTCCTCGTCGCCACCGTCGCTCATTCCTTCTACCTTCCCGGCGTGGCTCCCATGGATTTCCTCAAGGGTGATCTTCTCAAGGTGAAAGTGAACAAATTGACTTCAATAAAAACACAGCTTCCTTATTCCTATTACTCTCTACCTTATTGTAAACCAGAGAAAATAGTTGAAAGTGCTGAAAATCTTGGAGAAGTTCTTCGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767826.1
MEVIGRRSHAIQMCMYITLFLVATVAHSFYLPGVAPMDFLKGDLLKVKVNKLTSIKTQLPYSYYSLPYCKPEKIVESAENLGEVLRGDRIENSPYVFKMREPQICNSVCRAVLTAKDAKKFKKKIDDAYRVYMILDNLPLVVPYKRNDTDSMVYQHGFDVGFKGQYTGSSEKRYFVYNHLSFTVKYHKDEEMDAARIVGFEVRPFSIKHGYEGKWNNNKRLTTCDPHAKHTITSSQTPQEVKENMEIIFTYDVDFQESEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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