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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000558`

染色体: Chr06 坐标: 4772776-4774892 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000558`
名称	SmilChr06G000558
描述	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4772776 - 4774892 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988102`
GeneID	`130988102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988102`
原始查询	`SmilChr06G000558`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
产物	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 6-like
Arabidopsis	`AT4G30960` (SIP3) SOS3-interacting protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829221] identity=72.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0206700` (OsCIPK05) - identity=60.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF03822 (NAF); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF14531 (Kinase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767846.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057767846.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057767846.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057767846.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4772958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,B94
`Chr6:4773086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr6:4773113`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C51
`Chr6:4773113`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C51
`Chr6:4773177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:4773247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:4773493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B51
`Chr6:4773768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B33,B68,B78,C50
`Chr6:4773774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B76,B94
`Chr6:4773837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:4773871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr6:4773921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767846.1

416 aa

208

416

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kinase-like

NAF

PF00069 Pkinase 14-268 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 15-264 aa PF14531 Kinase-like 99-217 aa PF03822 NAF 288-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767846.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	14	268	6e-74	249.5	Protein kinase domain
`XP_057767846.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	15	264	1.1e-34	120.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057767846.1`	Pfam	`PF14531`	Kinase-like	Family	99	217	7.5e-06	26.1	Kinase-like
`XP_057767846.1`	Pfam	`PF03822`	NAF	Domain	288	346	2.3e-21	76.4	NAF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911863.1
GTTTAAATTTTCAGTTTAAATTAATCCGAGTATGCGATTGTTAGCCTAATCTCCCGCTGTCAATCTATCGCTAATCAGTACGCGGGTCCCACTGAATTATTAGCTTAGAATATACCAATTCTGTCGCCGTGGTAAAATTTACTAAACTATACCAATTTTCCTAGTAAAAAAACAGAAAGCGGAATTTAGTCCAACAAAGCCAGTTGCATATAACCAGGATCTCCGCACACGTGTCGATTTCGTGCCTACAGCCGTCCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988102
ATGGGATCGGAAGAAAAATGCGGTGTGCTGCATGGAAAATACGAATTGGGGCGGCTGCTAGGGCACGGAACGTTCGGGAAGGTGTATATGGCGAGAAATCTGCAGACCAACAGGAGCGTGGCGATGAAGGTGGTGGGGAAGGAGAAGGTGATCCGCGTGGGGATGATGGAGCAAGTGAAGCGGGAGATCTCGGTCATGAAGCTGGTGCACCACCCCAACATCGTCGAGCTCCACGAGGTCATGGCGAGCAAGACCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767846.1
MGSEEKCGVLHGKYELGRLLGHGTFGKVYMARNLQTNRSVAMKVVGKEKVIRVGMMEQVKREISVMKLVHHPNIVELHEVMASKTKIYFAMELVRGGELFARISRGRLREDAARSYFQQLISAIDFCHSRGVYHRDLKPENLLLDDQGNLKVTDFGLSALPDHLRQDGLLHTTCGTPAYVAPEVIGRKGYDGAKADIWSCGVILFVLLAGYLPFQDDNIISLYRKIYRGDFKCPPWLSPESRKLIGRMLEPNPIARISIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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