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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000560`

染色体: Chr06 坐标: 4777602-4779471 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000560`
名称	SmilChr06G000560
描述	probable protein phosphatase 2C 22
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4777602 - 4779471 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988103`
GeneID	`130988103`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988103`
原始查询	`SmilChr06G000560`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 22
产物	probable protein phosphatase 2C 22
Arabidopsis	`AT2G25620` (DBP1) DNA-binding protein phosphatase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817102] identity=71.2; qcov=1.01; evalue=6.76e-92; confidence=high
Rice	`Os06g0597200` (OsPP2C57) - identity=72.4; qcov=0.994; evalue=5.73e-92; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988103

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767847.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767847.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767847.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767847.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4777810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A25,B24,B34,C71
`Chr6:4777823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A20,B138,B91,C39,C52,C79
`Chr6:4777834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr6:4777848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr6:4777857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D9
`Chr6:4777859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B111,B47,B53
`Chr6:4777866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:4777883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr6:4777900`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A5,B106,B16,B2,B25,B29,B36,B44,B49,B56,B58,B69,B71,B74,B88,B95,B96,C17,C18,C2,C38,C4,C41,C43,C58,C6,C60,C62,C72,C78
`Chr6:4777904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B127,B7,B84
`Chr6:4777915`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B123
`Chr6:4777915`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767847.1

175 aa

175

PP2C

PF00481 PP2C 1-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767847.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	1	131	5e-38	131.9	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911864.1
AACTTGACAATAATAAAAAGTATCTCTCCATACCATCTATGGATCTAATTTTAGCGAAGGCCAAAAACGAATGTGACGGTTGGTCCCCAGTTCGGATCCTCTGTCCCAATTTCCTATCCCACTTCGTGTCCCCAAAGCAAAACTACAGCGTTTTGATTTAAATTAACTATTTTTTCTTTTGTTAACACTCCCACAGATCGGCTCGGCTGGTTGAAGCCGCAAGTCATCTTCTTCTTCTTCTTTCCTTTTCCATCTAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988103
ATGCTGTGTCGAAGGGGCAAAGCAATTGAGATGTCGAGAGATCATAAACCCGTTTGCTTGAGGGAGCTGCGTCGTATAGAAGCCTCGGGAGGTTATGTATACGATGGGTATCTCAACGGGCTGCTCAACATTGCTCGTGCATTGGGCGACTGGCACATGGAAGGGCTGAAAGGTGGTGATGGCGGACCACTTACATCGGAGCCTGATCTCATGACCACGAGGCTCACGGAGGAAGACGAGTTTCTCGTCATAGGGTGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767847.1
MLCRRGKAIEMSRDHKPVCLRELRRIEASGGYVYDGYLNGLLNIARALGDWHMEGLKGGDGGPLTSEPDLMTTRLTEEDEFLVIGCDSLWDVFLSQNALHFARRRLQEHNDPLMCSKDLVDKALKQRSGDNLSVVVVCFQPEPPPNLAVPRGRVHQSISTEGLKELQSFLDDLDI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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