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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000561`

染色体: Chr06 坐标: 4783392-4786614 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000561`
名称	SmilChr06G000561
描述	reticulon-like protein B21
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4783392 - 4786614 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988106`
GeneID	`130988106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988106`
原始查询	`SmilChr06G000561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reticulon-like protein B21
产物	reticulon-like protein B21
Arabidopsis	`AT5G58000` (AT5G58000) Reticulon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835911] identity=39; qcov=0.951; evalue=3.81e-92; confidence=medium
Rice	`Os08g0280600` - identity=62.1; qcov=0.452; evalue=9.62e-90; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02453 (Reticulon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057767849.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057767849.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057767849.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057767849.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4783570`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A2,B109,B110,B128,B22,B26,B3,B4,B40,B42,B43,B49,B50,B62,B70,B72,B79,B93,B99,C19,C21,C34,C36,C40,C41,C51,C54,C60,C78,C84,D1,D7
`Chr6:4783612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A1,A13,A7,A9,B120,B122,B123,B31,B5,B54,B59,B6,B7,B85,B88,C50,C67,C80
`Chr6:4783711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B44
`Chr6:4783770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:4784349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:4785335`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr6:4785861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:4786095`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr6:4786095`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr6:4786281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767849.1

467 aa

234

467

Reticulon

PF02453 Reticulon 219-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767849.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	219	372	7e-25	88.5	Reticulon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911866.1
TGCAAAATCTAAAGTAATACTATATCTAAAAAAGAAGAAAAGTGGAAAGCAAAAGAGGGGCAGCAGCATTCAAAGCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTGGGAGTGCATGACTTTCATCACAACCACCAGCACTACAAAACCTTGGATTCAAAGTCACAATAAATAGGGCACAGCACTTAAAGGAAACAGAGAGTGAAATGAGTAGCAAAGAAGCATTGGATTTGGATGGCAGCGCTAAAAAAGGCAGAGCTAGAAAAGCAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988106
ATGAGTAGCAAAGAAGCATTGGATTTGGATGGCAGCGCTAAAAAAGGCAGAGCTAGAAAAGCAGGGCCTGTTTGGGAGAGCAAAATGATGGTCAAAGCTGCAGACGTCAACACAGTAAAGATTCGCAGCAGAAGTAGTAGAATGAGCAATGCAGAGATTCAGGTAGACAAACAGAGTCCAACGAGTGCCATGAACAAGAGATCTGATTTCGGCATCATCAGGAAAAGTCCGCCTCAGATCAAGAGAACCAGATCCGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767849.1
MSSKEALDLDGSAKKGRARKAGPVWESKMMVKAADVNTVKIRSRSSRMSNAEIQVDKQSPTSAMNKRSDFGIIRKSPPQIKRTRSASTTTVADEINTLKLRKIKSGSDHQVPLDVDQHTTNDEIVVADLNEEDVGIIKSRHEADEAITTNNEDHHLEEEEEEEEEEEEKLVSEEKKLLHSNDRSPPPTVEEIAPARIQQKINPIPDHHHHGTSSRLESFADLIMWRDASRSAFVFGVGAFAIISSSYTKDLNISCISVLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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