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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000565`

染色体: Chr06 坐标: 4803593-4807451 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000565`
名称	SmilChr06G000565
描述	uncharacterized SmilChr06G000565
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4803593 - 4807451 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988109`
GeneID	`130988109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988109`
原始查询	`SmilChr06G000565`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0708600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0708600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G58030` (AT5G58030) Transport protein particle (TRAPP) component [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835915] identity=90.7; qcov=0.995; evalue=8.49e-134; confidence=high
Rice	`Os01g0708600` - identity=91.2; qcov=1; evalue=6.72e-135; confidence=high
GO	GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:1990070 (TRAPPI protein complex); GO:1990071 (TRAPPII protein complex); GO:1990072 (TRAPPIII protein complex)
KEGG	-
Pfam	PF04051 (TRAPP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767851.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057767851.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057767851.1`
4	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057767851.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057767851.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4805018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B81
`Chr6:4805025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:4805143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D4
`Chr6:4805302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B67,C44
`Chr6:4806174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr6:4806509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767851.1

194 aa

194

TRAPP

PF04051 TRAPP 30-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767851.1`	Pfam	`PF04051`	TRAPP	Family	30	182	3.3e-48	164.0	Transport protein particle (TRAPP) component

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911868.1
GATTATACAAATACAAATAAAGATTTACGCGATACCGGAAGGTCGTCGTTTTCACCCAGCATCCAGCTGCGCCGCTTGGTTCGCGCAACTGCTGCAAGCCAGCAACGCACCCTCTCAATCGACACTACGAAATTGCGTAGCAGTTAGAGAGTGAAAGAGAAATGGTAGGAGTTGGGAAAACCAAGCAATATTCAAACGTGCTAGATAGACCCATTGGTAAAGGGAAACAAGAGGTCAGTTTGAGTGCGTTCGCCTTCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988109
ATGGTAGGAGTTGGGAAAACCAAGCAATATTCAAACGTGCTAGATAGACCCATTGGTAAAGGGAAACAAGAGGTCAGTTTGAGTGCGTTCGCCTTCTTGTTTTCGGAGCTTGTTCAGTACAATCAGACTCAAGTTGACAACATAGCAGAGCTAGAACGAAGGTTAGAGGATGCTGGCTATGCCGTTGGAGCCAGGATTCTGGAACTGCTTTGTCATAGGGAGAAGGGTAACAGGAGGGAGACACGGCTATTGGGTATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767851.1
MVGVGKTKQYSNVLDRPIGKGKQEVSLSAFAFLFSELVQYNQTQVDNIAELERRLEDAGYAVGARILELLCHREKGNRRETRLLGILSFIHSTVWKVLFGKVADSLEKGTEHEDEYMISEKELLVNRFISIPKDMGAFNCGAFVAGIVRGVLDNAGFPAVVTAHFVPVDGQHRPRTTILIKFAEEVLRREAKLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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