当前解析结果
SmilChr06G000572| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000572 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000572 |
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 89B2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 4881993 - 4883584 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988117 |
|---|---|
| GeneID | 130988117 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988117 |
| 原始查询 | SmilChr06G000572 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-glycosyltransferase 89B2-like |
| 产物 | UDP-glycosyltransferase 89B2-like |
| Arabidopsis | AT1G73880 (UGT89B1)UDP-glucosyl transferase 89B1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843725] identity=51.5; qcov=0.992; evalue=2.11e-159; confidence=high |
| Rice | Os06g0282000- identity=43; qcov=0.996; evalue=1.56e-115; confidence=medium |
| GO | GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00201 (UDPGT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988117 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057767862.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057767862.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767862.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767862.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767862.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:4882217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,D11 |
Chr6:4882218 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
Chr6:4882271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,B91,C28,C73 |
Chr6:4882391 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr6:4882406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,D6 |
Chr6:4882418 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C71,D10 |
Chr6:4882454 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B100,B122 |
Chr6:4882466 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B111,B47,B53 |
Chr6:4882484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B59,C25 |
Chr6:4882502 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B111,B47,B53 |
Chr6:4882598 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr6:4882625 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B90 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767862.1PF00201
UDPGT 270-403 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767862.1 |
Pfam | PF00201 |
UDPGT | Family | 270 | 403 | 4.1e-19 | 69.5 | UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。