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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000573`

染色体: Chr06 坐标: 4893882-4896499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000573`
名称	SmilChr06G000573
描述	VAMP-like protein YKT61
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4893882 - 4896499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988120`
GeneID	`130988120`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988120`
原始查询	`SmilChr06G000573`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VAMP-like protein YKT61
产物	VAMP-like protein YKT61
Arabidopsis	`AT5G58060` (YKT61) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835918] identity=67.8; qcov=1.21; evalue=4.84e-96; confidence=high
Rice	`Os01g0866300` - identity=60.6; qcov=1.31; evalue=1.16e-85; confidence=high
GO	GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00957 (Synaptobrevin); PF13774 (Longin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988120

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057767869.1`
2	Endosome	内体	1.00000	`XP_057767869.1`
3	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057767869.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057767869.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057767869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4894119`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B100,B95
`Chr6:4894119`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B100,B95
`Chr6:4894501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A10,A18,A9,B125,B2,B45,B56,B62,B64,B65,B7,B72,C14,C21,C36,C40,C5,C54,C71,C78,D2
`Chr6:4894877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr6:4894894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr6:4896141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:4896191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr6:4896246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,D4
`Chr6:4896257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B100
`Chr6:4896263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:4896279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B33,B96,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767869.1

200 aa

100

200

Longin

Synaptobrevin

PF13774 Longin 34-119 aa PF00957 Synaptobrevin 141-194 aa

XP_057767870.1

165 aa

165

Longin

Synaptobrevin

PF13774 Longin 34-97 aa PF00957 Synaptobrevin 106-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767869.1`	Pfam	`PF13774`	Longin	Domain	34	119	7e-19	68.5	Regulated-SNARE-like domain
`XP_057767869.1`	Pfam	`PF00957`	Synaptobrevin	Domain	141	194	2.9e-14	53.5	Synaptobrevin
`XP_057767870.1`	Pfam	`PF13774`	Longin	Domain	34	97	3.8e-13	50.1	Regulated-SNARE-like domain
`XP_057767870.1`	Pfam	`PF00957`	Synaptobrevin	Domain	106	159	2.1e-14	53.9	Synaptobrevin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911887.1
TGGAGCTTCATCTACACCATCAAAATGGAAGATGCATTGTCAAGCTTTAAGTTGGCATTACCATTACCAATTGGAATCACAATCGAACAGCTCATCACTACCAATCCTCTAATGCAAAATCCTCCATAGATTTGTGAGTTTTGCTTCATAAACAGTGTCGAGAATAAAAGATGGTGAAAATCACGGCGTTGATGGTGGTGAAAGACAGCCCGCAGGGCTCCGATCCCGTCATTTTGGCCACCGCAACGGATCTCGGCAAT...

XM_057911886.1
GCTTCATCTACACCATCAAAATGGAAGATGCATTGTCAAGCTTTAAGTTGGCATTACCATTACCAATTGGAATCACAATCGAACAGCTCATCACTACCAATCCTCTAATGCAAAATCCTCCATAGATTTGTGAGTTTTGCTTCATAAACAGTGTCGAGAATAAAAGATGGTGAAAATCACGGCGTTGATGGTGGTGAAAGACAGCCCGCAGGGCTCCGATCCCGTCATTTTGGCCACCGCAACGGATCTCGGCAATTTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988120
ATGGTGAAAATCACGGCGTTGATGGTGGTGAAAGACAGCCCGCAGGGCTCCGATCCCGTCATTTTGGCCACCGCAACGGATCTCGGCAATTTCGGGTTTTTTCAGCGCCCCAGCGTTAAGGAATTTATTGTCTTCGTCGGTCGGACCGTTGCTAAACGGACCCCGCCCGGCCAGCGCCAATCCGTCCAGCATGAAGAATACAAAGTTCATTCATACAACCGCGACGGATTATGTGCATTGGGATTTATGGATGATCACTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767869.1
MVKITALMVVKDSPQGSDPVILATATDLGNFGFFQRPSVKEFIVFVGRTVAKRTPPGQRQSVQHEEYKVHSYNRDGLCALGFMDDHYPVRSAFSLLNQVLDEYQKNFGDSWKTQQADNAQQWPYLSEALTKFQDPAEADKLLKIQRELDETKIILHKTIESVLERGEKLDSLVDKSSDLSAASQMFYKQAKRSNQCCTVL

XP_057767870.1
MVKITALMVVKDSPQGSDPVILATATDLGNFGFFQRPSVKEFIVFVGRTVAKRTPPGQRQSVQHEEYKVHSYNRDGLCALGFMDDHYPVRSAFSLLNQDPAEADKLLKIQRELDETKIILHKTIESVLERGEKLDSLVDKSSDLSAASQMFYKQAKRSNQCCTVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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