当前解析结果
SmilChr06G000575| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000575 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000575 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000575 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 4900156 - 4903610 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988121 |
|---|---|
| GeneID | 130988121 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988121 |
| 原始查询 | SmilChr06G000575 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ubiquitin-associated protein (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816965]; symbol=AT2G24290; hit=AT2G24290; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | ubiquitin-associated protein (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816965]; symbol=AT2G24290; hit=AT2G24290; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G24290 (AT2G24290)ubiquitin-associated protein (DUF1068) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816965] identity=66.7; qcov=1.01; evalue=6.66e-78; confidence=high |
| Rice | Os04g0501800 (OSJNBa0029H02.27)- identity=59.1; qcov=0.994; evalue=6.96e-59; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06364 (DUF1068) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988121 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057767871.1 |
| 2 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057767871.1 |
| 3 | Cytoplasmic vesicle | 细胞质囊泡 | 0.20000 | XP_057767871.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767871.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767871.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:4900617 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:4900652 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C65,D9 |
Chr6:4900700 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,C16,C77 |
Chr6:4903219 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,C18 |
Chr6:4903293 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,B69 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767871.1PF06364
DUF1068 7-170 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767871.1 |
Pfam | PF06364 |
DUF1068 | Family | 7 | 170 | 2.2e-65 | 220.3 | Protein of unknown function (DUF1068) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。