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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000580`

染色体: Chr06 坐标: 4975291-4976810 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000580`
名称	SmilChr06G000580
描述	F-box protein CPR1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	4975291 - 4976810 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988125`
GeneID	`130988125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988125`
原始查询	`SmilChr06G000580`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein CPR1-like
产物	F-box protein CPR1-like
Arabidopsis	`AT4G12560` (CPR1) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826869] identity=29.3; qcov=1.02; evalue=2.79e-31; confidence=low
Rice	`Os09g0449600` (OsFbox490) - identity=24.3; qcov=0.964; evalue=9.02e-19; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like); PF24750 (b-prop_At3g26010-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767880.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767880.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767880.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767880.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:4975800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B61,C39,C56
`Chr6:4976181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:4976214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B37,B74,B75
`Chr6:4976403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A9,B86
`Chr6:4976432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr6:4976658`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A3,B105,B55,C16,C23,C48,C61,C77,C82
`Chr6:4976667`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B137,B59,C35,C54
`Chr6:4976667`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B137,B59,C35,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767880.1

389 aa

194

389

F-box-like

F-box

FBA_3

b-prop_At3g26010-like

FBA_1

PF12937 F-box-like 2-39 aa PF00646 F-box 2-41 aa PF08268 FBA_3 98-344 aa PF24750 b-prop_At3g26010-like 99-213 aa PF07734 FBA_1 100-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767880.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	2	39	5.4e-06	26.8	F-box-like
`XP_057767880.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	2	41	2.2e-09	37.5	F-box domain
`XP_057767880.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	98	344	4.6e-13	49.6	F-box associated beta propeller domain
`XP_057767880.1`	Pfam	`PF24750`	b-prop_At3g26010-like	Repeat	99	213	5.8e-08	32.9	F-box protein At3g26010-like, beta-propeller
`XP_057767880.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	100	225	4.9e-18	65.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911897.1
AATTACCGAACAAAAATATAAGATGAAATGTGTAGGCAGGGGAGTAGGCCTCTTGGACTTCCATCACACTGCGCGAGAAATATACTCATATCCTATCCCTTCTCTCTCTGTCTCATGATCACCTTCACCGCCTTACAATGTCCGACGTCCCCTCCGACCTCTTCCGCGACATTCTCCTCCGCCTTCCGGCGGACTCCCTCCTCCGCTTCCGAGCTGTCTGCAAGGACTGGCGCCGCACCATCGACTCCTCCTCCTTCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988125
ATGTCCGACGTCCCCTCCGACCTCTTCCGCGACATTCTCCTCCGCCTTCCGGCGGACTCCCTCCTCCGCTTCCGAGCTGTCTGCAAGGACTGGCGCCGCACCATCGACTCCTCCTCCTTCATCAAATCCCACACTCTCTACCAACACCACTCCCACACCCCCACTCTCCTCCTCCGAGACTCCGTATTCTGCCGCCTCTACTCCTTGTCTCTCCACCCTCCGCTAACCTACGCCCATCTCACCCGCATCAAGACGCTAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767880.1
MSDVPSDLFRDILLRLPADSLLRFRAVCKDWRRTIDSSSFIKSHTLYQHHSHTPTLLLRDSVFCRLYSLSLHPPLTYAHLTRIKTLVRTGVPLLRHLPTTSCNGLLLISHYNFTKKWVVWNPLTREFHTLPEPDFHIDIPFAGVGIGYDLSSDDYKVVKIYYWYRDGKIVYTTLIYSLKTGSWKPIKDFPCDSILLRSEGVYLDGALHWLSENVIMALDLGIEEYRLVLPPLTTRLGEPLDMYVDAMDGCLILSCYYTSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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