当前解析结果
SmilChr06G000597| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000597 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000597 |
| 描述 | putative glycerol-3-phosphate transporter 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 5134174 - 5136842 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988145 |
|---|---|
| GeneID | 130988145 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988145 |
| 原始查询 | SmilChr06G000597 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | putative glycerol-3-phosphate transporter 5 |
| 产物 | putative glycerol-3-phosphate transporter 5 |
| Arabidopsis | AT2G13100 (G3Pp5)Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815792] identity=63.8; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os06g0179900- identity=61.2; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055062 (phosphate ion homeostasis); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07690 (MFS_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988145 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole | 液泡 | 1.00000 | XP_057767900.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 1.00000 | XP_057767900.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767900.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767900.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767900.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:5134458 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B100,B35,B80,B99 |
Chr6:5134584 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr6:5134689 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,B124,B2,B46,C8 |
Chr6:5134716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B100,B35,B80,B99 |
Chr6:5134755 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B70,B71,C62,D3 |
Chr6:5134970 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr6:5135034 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B84,C17 |
Chr6:5135082 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C16,C52 |
Chr6:5135114 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C60 |
Chr6:5135153 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr6:5135299 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr6:5135310 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767900.1PF07690
MFS_1 109-440 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767900.1 |
Pfam | PF07690 |
MFS_1 | Family | 109 | 440 | 7.9e-40 | 137.5 | Major Facilitator Superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。