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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000607`

染色体: Chr06 坐标: 5240876-5246201 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000607`
名称	SmilChr06G000607
描述	uncharacterized SmilChr06G000607
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5240876 - 5246201 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988157`
GeneID	`130988157`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988157`
原始查询	`SmilChr06G000607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-associated (UBA)/TS-N domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815729]; symbol=NUB1; hit=AT2G12550; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquitin-associated (UBA)/TS-N domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815729]; symbol=NUB1; hit=AT2G12550; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G12550` (NUB1) ubiquitin-associated (UBA)/TS-N domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815729] identity=50.9; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0644300` - identity=36.9; qcov=0.335; evalue=3.21e-16; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:2000058 (regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00627 (UBA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988157

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057767916.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767916.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057767916.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767916.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5241136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr6:5241203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B10,B13,B28,C12
`Chr6:5243394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:5243458`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B78,B91
`Chr6:5243458`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B78,B91
`Chr6:5243522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B52,C9
`Chr6:5243682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B98,C78
`Chr6:5244785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:5245360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B51,B88
`Chr6:5245375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A5,A7,B77,D5
`Chr6:5245583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:5245849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A5,A7,B77,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767916.1

553 aa

276

553

UBA

PF00627 UBA 426-457 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767916.1`	Pfam	`PF00627`	UBA	Domain	426	457	5.7e-17	61.9	UBA/TS-N domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911933.1
AGTATTATTATTAAAATCAATAGTAAAAAAAGAGATGTGGGCCCTTGATTGTGGGCAAAATAAAAGCCTTGGTCCTCAAGAAACAAACAAGACTCCCATTCATCATCAACGAAATCGAACGTACAAATTAAACCCCTCATCATATCTGTTTCCCTTGGGTGTTGATTGCGATTCAAAGTGAAAGATAAAGATGGTGATGGGGAAACTCAAAATTGGCGGCGCATGGAGTGGGGTGTTGGAAGTTGAACTGGACGACTGGA...

XM_057911934.1
AGTATTATTATTAAAATCAATAGTAAAAAAAGAGATGTGGGCCCTTGATTGTGGGCAAAATAAAAGCCTTGGTCCTCAAGAAACAAACAAGACTCCCATTCATCATCAACGAAATCGAACGTACAAATTAAACCCCTCATCATATCTGTTTCCCTTGGGTGTTGATTGCGATTCAAAGTGAAAGATAAAGATGGTGATGGGGAAACTCAAAATTGGCGGCGCATGGAGTGGGGTGTTGGAAGTTGAACTGGACGACTGGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988157
ATGGTGATGGGGAAACTCAAAATTGGCGGCGCATGGAGTGGGGTGTTGGAAGTTGAACTGGACGACTGGACTGTCTCTATGCTGCGCGAAGAGGTCGCCAATCGATCCGGCTGCGCCACCCCCAACTGCCTAAACCTCATCTGCGCCGGCAAAGTCTTGAGAGACGGCGATGGCTCCGACAAGTTGACCCAATTGGGCCTCAAAAACAACGCCAGGATTCTCGCCGCCAAGGTTTCCGTTGATCAAGACGGCAAGTCCGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057767916.1
MVMGKLKIGGAWSGVLEVELDDWTVSMLREEVANRSGCATPNCLNLICAGKVLRDGDGSDKLTQLGLKNNARILAAKVSVDQDGKSVKDEFLAEEERANKLSRLKTAATKLATRHADGSLPVEDFNLELENQSGQKVQLGSETDQRAIMMGLMLHANGKALMRREQYKDALEVLNMGEESFSLCNPKVIEMVDNVPILQIDMVWCYFMLRDISWLSVAGIRLEKAREGIERAHGKESTRLRILQGGRYPELALHLRMELL...

XP_057767917.1
MVMGKLKIGGAWSGVLEVELDDWTVSMLREEVANRSGCATPNCLNLICAGKVLRDGDGSDKLTQLGLKNNARILAAKVSVDQDGKSVKDEFLAEEERANKLSRLKTAATKLATRHADGSLPVEDFNLELENQSGQKVQLGSETDQRAIMMGLMLHANGKALMRREQYKDALEVLNMGEESFSLCNPKVIEMVDNVPILQIDMVWCYFMLRDISWLSVAGIRLEKAREGIERAHGKESTRLRILQGGRYPELALHLRMELL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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