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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000623`

染色体: Chr06 坐标: 5475813-5480008 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000623`
名称	SmilChr06G000623
描述	uncharacterized methyltransferase At2g41040, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5475813 - 5480008 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988173`
GeneID	`130988173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988173`
原始查询	`SmilChr06G000623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0646000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0646000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G41040` (AT2G41040) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818703] identity=65.6; qcov=0.903; evalue=7.7e-151; confidence=high
Rice	`Os06g0646000` - identity=67.2; qcov=0.868; evalue=8.14e-152; confidence=high
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01209 (Ubie_methyltran); PF08241 (Methyltransf_11); PF08242 (Methyltransf_12); PF13489 (Methyltransf_23); PF13649 (Methyltransf_25); PF13847 (Methyltransf_31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767938.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057767938.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767938.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767938.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5476051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C28,C64,C66,C73
`Chr6:5476362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D7
`Chr6:5476362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:5477157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767938.1

341 aa

170

341

Ubie_methyltran

Methyltransf_23

Methyltransf_31

Methyltransf_25

Methyltransf_12

Methyltransf_11

PF01209 Ubie_methyltran 170-285 aa PF13489 Methyltransf_23 170-322 aa PF13847 Methyltransf_31 173-282 aa PF13649 Methyltransf_25 177-274 aa PF08242 Methyltransf_12 177-276 aa PF08241 Methyltransf_11 177-277 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767938.1`	Pfam	`PF01209`	Ubie_methyltran	Family	170	285	8.9e-11	42.3	ubiE/COQ5 methyltransferase family
`XP_057767938.1`	Pfam	`PF13489`	Methyltransf_23	Domain	170	322	4e-09	37.1	Methyltransferase domain
`XP_057767938.1`	Pfam	`PF13847`	Methyltransf_31	Domain	173	282	3.8e-11	43.7	Methyltransferase domain
`XP_057767938.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	177	274	3.6e-16	60.3	Methyltransferase domain
`XP_057767938.1`	Pfam	`PF08242`	Methyltransf_12	Domain	177	276	1.1e-09	39.6	Methyltransferase domain
`XP_057767938.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	177	277	1.5e-20	74.4	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911955.1
GTCCACATAAGTTTACGGCAATGCACAGAAAAATGAATCAAAAAAATCAGAAATTTCCTGCGCTTCTCCTTTCTCTCCTGAAATCACCAATATATATAGGCTTGTGTGTCTACGTTTATACATCAAAAACAGATTCATCAAATCCGACTAGAGGGGAAGCCCGCCACCGTCGTCATCCGTGAGGTATGGCCGTCGCTGCACAGCCGTCGCTCCGCCTCCACCAAAATTATGCTTTCTTCCGCACGAATCAAAGCTTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988173
ATGGCCGTCGCTGCACAGCCGTCGCTCCGCCTCCACCAAAATTATGCTTTCTTCCGCACGAATCAAAGCTTTCATCGTAATTCCCAGCTCCACCACCCTTCCCCCCGCTCCTCTCCTGCGAGAATTCGAGCAAGCTCTGCTGTTGCTCTGGAGCCCGAATCAACCACCGAAGTCCGAGATACTTCAAATGTTGACTTGTTTGCTTGTCCAATTTGTTATGAGCCATTGATACGAAAAGGCCCTTCAGGATTCAACTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767938.1
MAVAAQPSLRLHQNYAFFRTNQSFHRNSQLHHPSPRSSPARIRASSAVALEPESTTEVRDTSNVDLFACPICYEPLIRKGPSGFNLPAIYRSAFKCRTCKKSYSSKNMYLDLTVTSGTKEYNEFQPAGTELFRSPLVSFVYERGWRQNFNRSGFPGPDQEFSMAQEYFKPAEGGVLVDVSCGSGLFSRKFAKSGAYSRVVALDFSENMLRQCFDFIKNDDTILSSDLALVRADVSRLPFSSGSVDAVHAGAALHCWPSPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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