当前解析结果
SmilChr06G000631| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000631 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000631 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000631 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 5578554 - 5578892 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990395 |
|---|---|
| GeneID | 130990395 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990395 |
| 原始查询 | SmilChr06G000631 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0205337; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0205337; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0205337- identity=36; qcov=0.768; evalue=1.23e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990395 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770618.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770618.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770618.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770618.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770618.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:5578638 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,C33 |
Chr6:5578645 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:5578689 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:5578717 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B12,C49,C9 |
Chr6:5578773 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D10,D11 |
Chr6:5578796 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B135 |
Chr6:5578800 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 44 | A7,A8,B113,B124,B127,B128,B129,B132,B16,B18,B2,B25,B27,B29,B46,B57,B58,B67,B78,B83,B86,C14,C16,C18,C19,C31,C35,C36,C37,C4,C44,C45,C50,C52,C53,C57,C59,C6,C64,C66,C8,C81,D8,D9 |
Chr6:5578820 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D10,D11 |
Chr6:5578821 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:5578834 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B135 |
Chr6:5578853 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。